MirGeneDB 2.1
34 microRNA genes with node of origin G. gallus
Sort by genome coordinates Motifs
MirGeneDB ID ▲ MiRBase ID Family Seed 5p accession 3p accession Chromosome Start End Strand Node of origin (locus) Node of origin (family) 3' NTU  UG  UGUG CNNC
Gga-Mir-7-P2c gga-mir-7-1 MIR-7 GGAAGAC MIMAT0001157 None Z 40089600 40089663 - G. gallus Bilateria No 1
Gga-Mir-7-P2d gga-mir-7b MIR-7 GGAAGAC MIMAT0001192 None W 4705187 4705251 - G. gallus Bilateria No 1
Gga-Mir-122-P1 gga-mir-122-1 MIR-122 GGAGUGU MIMAT0001190 MIMAT0026550 Z 761062 761119 + G. gallus Vertebrata No 1 1 1
Gga-Mir-122-P2 gga-mir-122-2 MIR-122 GGAGUGU MIMAT0001190 MIMAT0026550 W 2916998 2917055 - G. gallus Vertebrata No 1 1
Gga-Mir-1452 gga-mir-1452 MIR-1452 UGAGAUA MIMAT0007328 None Z 66646493 66646555 + G. gallus G. gallus No 1
Gga-Mir-1550 gga-mir-1550 MIR-1550 GAUGGGG MIMAT0007403 MIMAT0007404 12 13251466 13251522 + G. gallus G. gallus No
Gga-Mir-1551 gga-mir-1551 MIR-1551 UAGCAGC MIMAT0007405 MIMAT0007406 14 5612819 5612882 + G. gallus G. gallus No 1 1
Gga-Mir-1553 gga-mir-1553 MIR-1553 GUGGUGG MIMAT0007409 MIMAT0007410 7 23744593 23744649 + G. gallus G. gallus No 1
Gga-Mir-1555 gga-mir-1555 MIR-1555 AGGGUUA MIMAT0026774 MIMAT0007412 1 146371379 146371439 - G. gallus G. gallus No 1
Gga-Mir-1560 gga-mir-1560 MIR-1560 GCAUCUC MIMAT0007417 MIMAT0007418 11 18630380 18630438 - G. gallus G. gallus No
Gga-Mir-1591 gga-mir-1591 MIR-1591 GAUUCAU MIMAT0007453 MIMAT0007454 7 19311636 19311696 - G. gallus G. gallus No 1
Gga-Mir-1596 gga-mir-1596 MIR-1596 UUCUCCU MIMAT0007460 MIMAT0007461 1 6347558 6347621 + G. gallus G. gallus No
Gga-Mir-1601 gga-mir-1601 MIR-1601 GCUCUGC None MIMAT0007467 24 2042406 2042470 + G. gallus G. gallus No 1
Gga-Mir-1618 gga-mir-1618 MIR-1618 GAGCCCG MIMAT0026776 MIMAT0007485 8 7822239 7822298 + G. gallus G. gallus No
Gga-Mir-1651 gga-mir-1651 MIR-1651 UGCUUUU MIMAT0007529 MIMAT0007530 1 1178478 1178535 + G. gallus G. gallus No
Gga-Mir-1663 gga-mir-1663 MIR-1663 ACCGCUG MIMAT0007544 MIMAT0007545 5 16028827 16028883 + G. gallus G. gallus No 1
Gga-Mir-1668 gga-mir-1668 MIR-1668 GCUGUGU MIMAT0007551 MIMAT0007552 33 5702513 5702569 - G. gallus G. gallus No 1
Gga-Mir-1669 gga-mir-1669 MIR-1669 UGGGCUC None MIMAT0007553 26 3626810 3626871 + G. gallus G. gallus No
Gga-Mir-1677-P3 gga-mir-1744 MIR-1677 CUUCAAC MIMAT0007648 MIMAT0007649 10 10362855 10362917 + G. gallus Diapsida No
Gga-Mir-1685 gga-mir-1685 MIR-1685 CAGUAAU MIMAT0007573 MIMAT0007574 2 24783243 24783306 + G. gallus G. gallus No
Gga-Mir-1689 gga-mir-1689 MIR-1689 CGGUGAC MIMAT0007579 MIMAT0007580 19 9540181 9540243 - G. gallus G. gallus No 1
Gga-Mir-1728 gga-mir-1728 MIR-1728 GGCUUCU MIMAT0007627 MIMAT0007628 4 10929477 10929544 - G. gallus G. gallus No 1
Gga-Mir-1731 gga-mir-1731 MIR-1731 CUUGACU MIMAT0007633 MIMAT0026780 12 11048722 11048777 - G. gallus G. gallus No
Gga-Mir-1736 gga-mir-1736 MIR-1736 GCACCUU MIMAT0007638 MIMAT0007639 1 140535089 140535155 - G. gallus G. gallus No
Gga-Mir-1751 gga-mir-1751 MIR-1751 UGAAGGA MIMAT0007658 None 4 50089462 50089525 + G. gallus G. gallus No 1
Gga-Mir-1774 gga-mir-1774 MIR-1774 CCCUGCU None MIMAT0007685 28 1464741 1464800 + G. gallus G. gallus No 1
Gga-Mir-1806 gga-mir-1806 MIR-1806 GGCAGGA None MIMAT0007724 1 95234304 95234363 - G. gallus G. gallus No 1
Gga-Mir-7441 gga-mir-7441 MIR-7441 UGAGGAG MIMAT0029036 MIMAT0029037 17 2437879 2437941 + G. gallus G. gallus No
Gga-Mir-7462 gga-mir-7462 MIR-7462 AACCUCA MIMAT0029078 MIMAT0029079 3 54227861 54227921 + G. gallus G. gallus No
Gga-Mir-10585 gga-mir-10585 MIR-10585 GAUGAAA MIMAT0049964 MIMAT0049965 2 473003 473062 + G. gallus G. gallus No 1 1
Gga-Mir-12223 gga-mir-12223 MIR-12223 AGUUCAG MIMAT0049923 MIMAT0049924 13 17776577 17776631 - G. gallus G. gallus No
Gga-Mir-12246 gga-mir-12246 MIR-12246 UGGGUGG MIMAT0049981 MIMAT0049982 21 5009985 5010042 - G. gallus G. gallus No 1
Gga-Mir-12265 gga-mir-12265 MIR-12265 UGGCUGU MIMAT0050020 MIMAT0050021 3 96496738 96496796 - G. gallus G. gallus No 1
Gga-Mir-12277 gga-mir-12277 MIR-12277 UUGGGUG MIMAT0050048 MIMAT0050049 5 348189 348254 + G. gallus G. gallus No 1

Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all