MirGeneDB ID | Aae-Mir-11893-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-11893 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UCCUGAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Yellow fever mosquito (Aedes aegypti) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | aae-mir-11893-2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Aae-Mir-11893-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | A. aegypti | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | A. aegypti | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Aaeg_L3) |
supercont1.154: 394987-395045 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-11893-P1) |
Mir-11893-P1
supercont1.154: 394987-395045 [+]
Ensembl
Mir-11893-P2 supercont1.154: 420378-420436 [+] Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UGCAUUAUGGACAUCCGCAGUUCAAGGAUGGUAAGUAGAUAAAUCAGAAAGACGUUUUUAUCGUUUCUUCCUGACUUAUACGCUUACCUCACAGGUUGGUACUGGAUCGAUCCGAACUUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 UGCAUUAUGGACAUCCGCAGUUCAAG---| U AG A A CGUUUU GA GGUAAGU AUAA UCAG AAGA \ CU CCAUUCG UAUU AGUC UUCU U UUCAAGCCUAGCUAGGUCAUGGUUGGACA^ - CA C C UUGCUA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Aae-Mir-11893-P1_5p* |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- GUAAGUAGAUAAAUCAGAAAGA -22
Get sequence
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Mature sequence | Aae-Mir-11893-P1_3p |
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mirBase accession | MIMAT0045989 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
37- UUCCUGACUUAUACGCUUACCU -59
Get sequence
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