MirGeneDB ID | Bta-Mir-2475 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-2475 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | CUUCAGG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Cow (Bos taurus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | bta-mir-2475 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | B. taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | B. taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCF_002263795.1_ARS-UCD1.2_BTA) |
NC_037335.1: 81616377-81616437 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-2475) |
Mir-2475
NC_037335.1: 81616377-81616437 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-23-P2 NC_037335.1: 81617032-81617091 [+] UCSC Ensembl Mir-27-P2 NC_037335.1: 81617258-81617320 [+] UCSC Ensembl Mir-24-P2 NC_037335.1: 81617799-81617858 [+] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UCAGACAGUGAUCAGUGCCAGUCAUGUUUCUCUUCAGGUUUGCCACUUCACAGAGAGUUUGUGUUGCUUGAAGUGUGUGAAACUGCAGCGGUGCAGGCUGUGCCUUUGAUGUUCCCUGUGCGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 UCAGACAGUGAUCAGUGC---| A U U U G UG - CAGAGAGU CAGUC UGU UC CU CAG UU C CACUUCA U GUCGG ACG GG GA GUC AA G GUGAAGU U CGUGUCCCUUGUAGUUUCCGU^ - U C C A GU U UCGUUGUG . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Bta-Mir-2475_5p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UCUUCAGGUUUGCCACUUCACA -22
Get sequence
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Co-mature sequence | Bta-Mir-2475_3p |
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mirBase accession | MIMAT0012066 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
38- UGAAGUGUGUGAAACUGCAGCGG -61
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: bta-miR-2475 |