MirGeneDB ID | Cel-Mir-231 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-231 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AAGCUCG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Roundworm (Caenorhabditis elegans) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | cel-mir-231 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Cbr-Mir-231 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Caenorhabditis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Caenorhabditis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (ce11) |
chrIII: 7545072-7545138 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CUAUUUUCAAAGUUAGCACCACAGGUUGUUCUGACUGUUUCAAAAGCUUGUAGUAUCUUAAUAAAUAAACAUAUAAGCUCGUGAUCAACAGGCAGAACAACUCGGUUUUGUGUGCACGCUGAUCCUAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 CUAUUUUCAAAGUUAGC----| ACA A -- AA GUAUCUUAA ACC GGUUGUUCUG CUGUU UCA AGCUUGUA \ UGG UCAACAAGAC GACAA AGU UCGAAUAU U AUCCUAGUCGCACGUGUGUUU^ C-- G CU GC ACAAAUAAA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Cel-Mir-231_5p* |
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mirBase accession | MIMAT0020328 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CUGACUGUUUCAAAAGCUUGUA -22
Get sequence
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Mature sequence | Cel-Mir-231_3p |
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mirBase accession | MIMAT0000286 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
43- UAAGCUCGUGAUCAACAGGCAGAA -67
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000286 TargetScanWorm: cel-miR-231 |