MirGeneDB ID | Cel-Mir-77 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-77 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UCAUCAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Roundworm (Caenorhabditis elegans) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | cel-mir-77 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Asu-Mir-77 Cbr-Mir-77-P1 Cbr-Mir-77-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Chromadorea | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Chromadorea | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (ce11) |
chrII: 12519291-12519350 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UUUUUUUGCAUCUGCCAAACCGCCCGUUUGGAUGGUUGUGCUCUGAGGAAAUACGCACAGAAUGUCAUUUCAUCAGGCCAUAGCUGUCCAAAUUGGUAUAGAGUUUGGAAUGUUGAAUCAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 UUUUUUUGCAUCUGCCAAACC--| C CU G ACGCAC GCC GUUUGGAUGGUUGUG CUGA GAAAU A UGG UAAACCUGUCGAUAC GACU CUUUA G ACUAAGUUGUAAGGUUUGAGAUA^ U CG A CUGUAA . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Cel-Mir-77_5p* |
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mirBase accession | MIMAT0020774 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- GAUGGUUGUGCUCUGAGGAAAU -22
Get sequence
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Mature sequence | Cel-Mir-77_3p |
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mirBase accession | MIMAT0000049 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
38- UUCAUCAGGCCAUAGCUGUCCA -60
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000049 TargetScanWorm: cel-miR-77 |