| MirGeneDB ID | Cfa-Mir-95 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-95 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UCAACGG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Dog (Canis familiaris) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | cfa-mir-95 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-95 Cja-Mir-95 Cpo-Mir-95 Dno-Mir-95 Eca-Mir-95 Hsa-Mir-95 Laf-Mir-95 Mml-Mir-95 Mmr-Mir-95 Pab-Mir-95 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (canFam3_add) |
chr3: 59867532-59867588 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GUAGGAUUGUGACACUCAACACAGUGGACGCUCAAUAAAUGUUUGUUGAAUUGAGAUGCAUUAAAUUCAACGGGUAUUUAUUGAGCACCCACUCUGUGCCAGACGCUGUGUGGGGCGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 GUAGGAUUGUGACACUCA--| C AC UU GAGAU ACA AGUGG GCUCAAUAAAUG UGUUGAAUU \ UGU UCACC CGAGUUAUUUAU GCAACUUAA G GCGGGGUGUGUCGCAGACCG^ C CA GG AUUAC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Cfa-Mir-95_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CUCAAUAAAUGUUUGUUGAAUU -22
Get sequence
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| Mature sequence | Cfa-Mir-95_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0009878 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
35- UUCAACGGGUAUUUAUUGAGCA -57
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: cfa-miR-95 miRDB: MIMAT0009878 |
