MirGeneDB ID | Dan-Novel-15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | DAN-NOVEL-15 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AGUACAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Fruit fly (Drosophila ananassae) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | D. ananassae | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | D. ananassae | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Dana_caf1) |
scaffold_13266: 4131702-4131759 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Novel-15) |
Mir-7
scaffold_13266: 4109379-4109440 [-]
Ensembl
Mir-92-P7 scaffold_13266: 4132688-4132749 [+] Ensembl Mir-92-P6 scaffold_13266: 4132944-4133001 [+] Ensembl Mir-92-P5 scaffold_13266: 4133064-4133125 [+] Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AAAGAAAAAAAAAGUUGUUCAUAAUUUCUUAGAACCGGCAUCGUGUAUCUUGUCUUAUUCUCGCACAAGUACACGGUUCCGACUCUAUGUAUUUUGAAACAAUUCUUCUGAAUUAAGUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 AAAGAAAAAAAAAGUUG---| U UUCU AC C U CUUAU UUCA AAU UAGA CGG AUCGUGUA CUUGU \ AAGU UUA AUCU GCC UGGCACAU GAACA U UGAAUUAAGUCUUCUUAACA^ U UGU- CA U - CGCUC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Dan-Novel-15_5p* |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AGAACCGGCAUCGUGUAUCUUGU -23
Get sequence
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Mature sequence | Dan-Novel-15_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
36- AAGUACACGGUUCCGACUCUAU -58
Get sequence
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