| MirGeneDB ID | Dme-Mir-14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-14 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CAGUCUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila melanogaster) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dme-mir-14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-14 Aga-Mir-14 Bge-Mir-14 Dan-Mir-14 Dlo-Mir-14 Dmo-Mir-14 Dsi-Mir-14 Dya-Mir-14 Gpa-Mir-14 Hme-Mir-14 Tca-Mir-14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Neoptera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Neoptera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Drosophila_melanogaster_BDGP6) |
2R: 9553765-9553823 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AACAACAACGUAACGUACUGCAACCUAUGUGGGAGCGAGACGGGGACUCACUGUGCUUAUUAAAUAGUCAGUCUUUUUCUCUCUCCUAUACAAAUUGCGGGCGUAUCAUCAUGGCACAAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 AACAACAACGUAACGUA--| CCUA C CG C GUGCUU CUGCAA UGUGGGAG GAGA GGGACU ACU \ GGCGUU AUAUCCUC CUCU UUCUGA UGA A AACACGGUACUACUAUGCG^ AAAC U UU C UAAAUU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17), UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dme-Mir-14_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0020798 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GGGAGCGAGACGGGGACUCACU -22
Get sequence
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| Mature sequence | Dme-Mir-14_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0000120 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- UCAGUCUUUUUCUCUCUCCUAU -59
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000120 TargetScanFly: dme-miR-14 |
