MirGeneDB ID | Dme-Mir-984 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-984 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GAGGUAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Fruit fly (Drosophila melanogaster) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dme-mir-984 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | D. melanogaster | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | D. melanogaster | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Drosophila_melanogaster_BDGP6) |
X: 4368660-4368720 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-984) |
Mir-982
X: 4365822-4365883 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-303 X: 4366184-4366240 [-] UCSC Ensembl Mir-983-P1 X: 4368325-4368382 [-] UCSC Ensembl Mir-983-P2 X: 4368325-4368382 [-] UCSC Ensembl Mir-984 X: 4368660-4368720 [-] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UGGCUUCUAUUGCGUAGAAACAAAUUUCAUUGAGGUAAAUACGGUUGGAAUUUUGUCUUUUAACUAUAAAUCCAACCGAAUUUGGCUCGGCGAAAUUUUUCAGUUUACUGGCGUCGAAAAAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 UGGCUUCUAUUGCGUAGAAAC--| A G A A UUGUCUU AAAUUUC UUGAG UAAAU CGGUUGGA UU \ UUUAAAG GGCUC GUUUA GCCAACCU AA U AAAAAGCUGCGGUCAUUUGACUU^ C G A A UAUCAAU . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Dme-Mir-984_5p |
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mirBase accession | MIMAT0005500 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UGAGGUAAAUACGGUUGGAAUUU -23
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0005500 TargetScanFly: dme-miR-984 |
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Star sequence | Dme-Mir-984_3p* |
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mirBase accession | MIMAT0020881 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
39- AUCCAACCGAAUUUGGCUCGGC -61
Get sequence
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