| MirGeneDB ID | Dme-Mir-982 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-982 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CCUGGAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila melanogaster) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dme-mir-982 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Dsi-Mir-982-P1 Dsi-Mir-982-P2 Dsi-Mir-982-P3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | D. melanogaster + D. simulans | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | D. melanogaster + D. simulans | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Drosophila_melanogaster_BDGP6) |
X: 4365822-4365883 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-982) |
Mir-982
X: 4365822-4365883 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-303 X: 4366184-4366240 [-] UCSC Ensembl Mir-983-P1 X: 4368325-4368382 [-] UCSC Ensembl Mir-983-P2 X: 4368325-4368382 [-] UCSC Ensembl Mir-984 X: 4368660-4368720 [-] UCSC Ensembl |
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| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UAUCAAGUUAAAAAACGAAAUCAUGUUAGAUCCUGGACAAAUAUGAAGUAAAUUGUUUUUAUGCAUCAAUUACUUGAUAUUCAUCCUUGAACUAAAUGGUUUUAGAGCUGCAAGAAAAAUUGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 UAUCAAGUUAAAAAACG---| G A CU CA G AUUGUUUU AAAUCAU UUAG UC GGA AAUAU AAGUAA U UUUGGUA AAUC AG CCU UUAUA UUCAUU A GUUAAAAAGAACGUCGAGAU^ - A UU AC G AACUACGU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17), UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Dme-Mir-982_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0005498 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UCCUGGACAAAUAUGAAGUAAAU -23
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0005498 TargetScanFly: dme-miR-982 |
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| Star sequence | Dme-Mir-982_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0020879 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- UUACUUGAUAUUCAUCCUUGAAC -62
Get sequence
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