| MirGeneDB ID | Dsi-Mir-982-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-982 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CUACACG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila simulans) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dsi-mir-982b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Dsi-Mir-982-P1 Dsi-Mir-982-P3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Dme-Mir-982 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | D. simulans | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | D. melanogaster + D. simulans | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Drosophila_simulans.ASM75419v3.dna.toplevel) |
X: 3953690-3953747 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-982-P2) |
Mir-982-P3
X: 3953288-3953349 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-2582-P2 X: 3953548-3953605 [-] UCSC Ensembl Mir-982-P2 X: 3953690-3953747 [-] UCSC Ensembl Mir-2582-P1 X: 3954183-3954240 [-] UCSC Ensembl Mir-982-P1 X: 3954323-3954388 [-] UCSC Ensembl Mir-303 X: 3955015-3955071 [-] UCSC Ensembl Mir-983 X: 3957115-3957173 [-] UCSC Ensembl |
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| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UGAAGUUAAAAAACAAAAUCAUGCUAGAUCAAGAACAAAUAUCAUGUAAAUUGAUUUUUUAAAUCAACUACACGAUAUUCGUUCUUGAGCUUAAUGGUUCUAGAGCUGCAAGAAAAAUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 UGAAGUUAAAAAACAAA---| GCU A A A AA AUUUU AUCAU AG UCAAGAAC AAUAUC UGUA UUG \ UGGUA UC AGUUCUUG UUAUAG ACAU AAC U UAAAAAGAACGUCGAGAUCU^ AU- G C C C- UAAAU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dsi-Mir-982-P2_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | MIMAT0037360 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AAGAACAAAUAUCAUGUAAAUUG -23
Get sequence
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| Mature sequence | Dsi-Mir-982-P2_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0012514 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- ACUACACGAUAUUCGUUCUUGA -58
Get sequence
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