MirGeneDB ID | Dsi-Mir-303 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-303 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UGGCAUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Fruit fly (Drosophila simulans) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dsi-mir-303 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Dme-Mir-303 Dya-Mir-303 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | D. melanogaster subgroup | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | D. melanogaster subgroup | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Drosophila_simulans.ASM75419v3.dna.toplevel) |
X: 3955015-3955071 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-303) |
Mir-982-P3
X: 3953288-3953349 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-2582-P2 X: 3953548-3953605 [-] UCSC Ensembl Mir-982-P2 X: 3953690-3953747 [-] UCSC Ensembl Mir-2582-P1 X: 3954183-3954240 [-] UCSC Ensembl Mir-982-P1 X: 3954323-3954388 [-] UCSC Ensembl Mir-303 X: 3955015-3955071 [-] UCSC Ensembl Mir-983 X: 3957115-3957173 [-] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UUGUGUUAAAAACCAAUGUGAUCUCUUGCUUUGGCAUUAAAGGAAGCUAGUUUAAUUACGAAAACUAGUUUCCUCUAACGUUUCAAACAAUACAUCAUGUGUCGUCGCAUCGAUGAAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 UUGUGUUAAAAACCAAU-- CUC C --| A A UAAU GUGAU UUG UUUG GC UUA AGGAAGCUAGUU U UACUA AAC AAAC UG AAU UCCUUUGAUCAA A AAGUAGCUACGCUGCUGUG CAU - UU^ C C AAGC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Dsi-Mir-303_5p |
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mirBase accession | MIMAT0012516 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UUGGCAUUAAAGGAAGCUAGUU -22
Get sequence
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Star sequence | Dsi-Mir-303_3p* |
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mirBase accession | MIMAT0037362 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
34- CUAGUUUCCUCUAACGUUUCAAA -57
Get sequence
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