MirGeneDB ID | Dme-Mir-985 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-985 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AAAUGUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Fruit fly (Drosophila melanogaster) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dme-mir-985 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Dsi-Mir-985 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | D. melanogaster + D. simulans | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | D. melanogaster + D. simulans | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Drosophila_melanogaster_BDGP6) |
X: 16191270-16191324 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UUUAUAAUUAUAUUAUAUAUAAUAGCACUGCUGGCUCAUUGGUACAUUUCAUAAGUACCUUAUCAAAUGUUCCAAUGGUCGGGCAGAGCUAUUAUUUGUCCAUGUUUUGGACUAGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 UUUAUAAUUAUAUUAUAU-- A -| U U C AAGU AUAAUAGC CUG CUGGC CAUUGG ACAUUU AU \ UAUUAUCG GAC GGCUG GUAACC UGUAAA UA A GAUCAGGUUUUGUACCUGUU A G^ - U C UUCC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Dme-Mir-985_5p* |
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mirBase accession | MIMAT0020883 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CUGGCUCAUUGGUACAUUUCAU -22
Get sequence
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Mature sequence | Dme-Mir-985_3p |
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mirBase accession | MIMAT0005502 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
33- CAAAUGUUCCAAUGGUCGGGCA -55
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0005502 TargetScanFly: dme-miR-985 |