MirGeneDB ID | Dya-Mir-976 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-976 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UGGAUUA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Fruit fly (Drosophila yakuba) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dya-mir-976 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Dan-Mir-976 Dme-Mir-976 Dmo-Mir-976 Dsi-Mir-976 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Drosophila | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Drosophila | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Drosophila_yakuba.dyak_caf1.dna.toplevel) |
X: 11885829-11885886 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-976) |
Mir-978
X: 11883774-11883834 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-977 X: 11885660-11885723 [-] UCSC Ensembl Mir-976 X: 11885829-11885886 [-] UCSC Ensembl Mir-975 X: 11885984-11886046 [-] UCSC Ensembl Mir-9690 X: 11886163-11886224 [-] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GUGAGUGAGAAUCGCAUGCAGUGCCACGACAUUGGUGAGGGCAUCUCCAAUGGGGACCCGGCAUCAUUGGAUUAGUUCUCAUUAAUGCCGGAGCACUGCACCUACCAACUUCGCACGGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 GUGAGUGAGAAUCGCAU--| CA A AUC GGGAC GCAGUGC CG CAUUGGUGAGGGC UCCAAUG C CGUCACG GC GUAAUUACUCUUG AGGUUAC C GGCACGCUUCAACCAUCCA^ AG C AUU UACGG 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Dya-Mir-976_5p* |
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mirBase accession | MIMAT0039182 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AUUGGUGAGGGCAUCUCCAAUG -22
Get sequence
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Mature sequence | Dya-Mir-976_3p |
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mirBase accession | MIMAT0039183 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
36- UUGGAUUAGUUCUCAUUAAUGC -58
Get sequence
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