MirGeneDB ID | Dya-Mir-991 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-991 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UAAAGCC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Fruit fly (Drosophila yakuba) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dya-mir-991 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Dme-Mir-991 Dsi-Mir-991 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | D. melanogaster subgroup | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | D. melanogaster subgroup | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Drosophila_yakuba.dyak_caf1.dna.toplevel) |
2R: 12723801-12723862 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-991) |
Mir-7
2R: 12702754-12702815 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-992 2R: 12723689-12723744 [+] UCSC Ensembl Mir-991 2R: 12723801-12723862 [+] UCSC Ensembl Mir-9681 2R: 12724136-12724190 [+] UCSC Ensembl Mir-92-P6a 2R: 12724560-12724622 [+] UCSC Ensembl Mir-92-P7 2R: 12724704-12724764 [+] UCSC Ensembl Mir-92-P6b 2R: 12724839-12724897 [+] UCSC Ensembl Mir-92-P5 2R: 12724949-12725008 [+] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AUACAAAAAAAUCGCCUGCAGUUUCAAGCUUUUCCCCACUCCUUGCUUUAAUACUUAUUUUAACGUCGUAUUAAAGCCAGAGUUUGGAAAGUUUUGAUUCUGCAUUAGAAAUCGCCACCCAAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 AUACAAAAAAAUCGCCU--| UU C CC CUU CUUAUUU GCAG UCAAG UUUUCC ACUC GCUUUAAUA \ CGUC AGUUU GAAAGG UGAG CGAAAUUAU U AACCCACCGCUAAAGAUUA^ UU U UU AC- GCUGCAA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Dya-Mir-991_5p* |
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mirBase accession | MIMAT0039170 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UUUCCCCACUCCUUGCUUUAAUA -23
Get sequence
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Mature sequence | Dya-Mir-991_3p |
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mirBase accession | MIMAT0039171 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
40- UUAAAGCCAGAGUUUGGAAAGU -62
Get sequence
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