| MirGeneDB ID | Dme-Mir-991 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-991 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UAAAGUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila melanogaster) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dme-mir-991 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Dsi-Mir-991 Dya-Mir-991 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | D. melanogaster subgroup | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | D. melanogaster subgroup | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Drosophila_melanogaster_BDGP6) |
2R: 20585214-20585275 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-991) |
Mir-92-P5
2R: 20583766-20583825 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-92-P6 2R: 20583888-20583946 [-] UCSC Ensembl Mir-92-P7 2R: 20584058-20584117 [-] UCSC Ensembl Mir-92-P8 2R: 20584194-20584254 [-] UCSC Ensembl Mir-991 2R: 20585214-20585275 [-] UCSC Ensembl Mir-992 2R: 20585332-20585390 [-] UCSC Ensembl Mir-7 2R: 20606081-20606142 [+] UCSC Ensembl |
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| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AUAUCAAAACUAUCACUGCAGUUUCAGGCUUUUCCCAACUACACCUAUUAAUACAUAUUUUAACGUCCUAUUAAAGUUGUAGUUUGGAAAGUUUUGGUUUUGCAUUAGAAAUCGCCACUCAAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 AUAUCAAAACUAUCACU--| UU C C C A CAUAUUU GCAG UCAGG UUUUCC AACUACA CU UUAAUA \ CGUU GGUUU GAAAGG UUGAUGU GA AAUUAU U AACUCACCGCUAAAGAUUA^ UU U U U - CCUGCAA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dme-Mir-991_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0020890 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UUUCCCAACUACACCUAUUAAUA -23
Get sequence
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| Mature sequence | Dme-Mir-991_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0005509 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
40- UUAAAGUUGUAGUUUGGAAAGU -62
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0005509 TargetScanFly: dme-miR-991 |
