MirGeneDB ID | Dme-Mir-92-P5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-92 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AUUGCAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Fruit fly (Drosophila melanogaster) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dme-mir-310 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Dme-Mir-92-P3 Dme-Mir-92-P4 Dme-Mir-92-P6 Dme-Mir-92-P7 Dme-Mir-92-P8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Asu-Mir-92 Bfl-Mir-92-o5 Bla-Mir-92-o5 Cel-Mir-92 Dan-Mir-92-P5 Dmo-Mir-92-P5 Dsi-Mir-92-P5 Dya-Mir-92-P5 Esc-Mir-92 Gsp-Mir-92 Hmi-Mir-92 Isc-Mir-92 Obi-Mir-92 Sme-Mir-92 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Drosophila | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Drosophila_melanogaster_BDGP6) |
2R: 20583766-20583825 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-92-P5) |
Mir-92-P5
2R: 20583766-20583825 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-92-P6 2R: 20583888-20583946 [-] UCSC Ensembl Mir-92-P7 2R: 20584058-20584117 [-] UCSC Ensembl Mir-92-P8 2R: 20584194-20584254 [-] UCSC Ensembl Mir-991 2R: 20585214-20585275 [-] UCSC Ensembl Mir-992 2R: 20585332-20585390 [-] UCSC Ensembl Mir-7 2R: 20606081-20606142 [+] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AAAAGUGUUUGCGAAAACAUAAACAUUUGCAGGGCGGGUCGUGUGUCAGUGUAUUUAUAUCUUAGCUAUAUUGCACACUUCCCGGCCUUUAAAUGUCCAAUGUUUCAACAUUUAAAUCUGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 AAAAGUGUUUGCGAAAA- AA-| C G UC U UUUAUA CAU ACAUUUG AGG CGGG GUGUG CAGUGUA \ GUA UGUAAAU UCC GCCC CACAC GUUAUAU U GUCUAAAUUUACAACUUU ACC^ U G UU - CGAUUC . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Dme-Mir-92-P5_5p* |
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mirBase accession | MIMAT0020836 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AGGGCGGGUCGUGUGUCAGUGUA -23
Get sequence
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Mature sequence | Dme-Mir-92-P5_3p |
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mirBase accession | MIMAT0000402 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
38- UAUUGCACACUUCCCGGCCUUU -60
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000402 TargetScanFly: dme-miR-310 |