MirGeneDB ID | Dme-Mir-92-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-92 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AUUGCAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Fruit fly (Drosophila melanogaster) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dme-mir-92b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Dme-Mir-92-P3 Dme-Mir-92-P5 Dme-Mir-92-P6 Dme-Mir-92-P7 Dme-Mir-92-P8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aae-Mir-92-P4 Aga-Mir-92-P4 Asu-Mir-92 Bfl-Mir-92-o4 Bge-Mir-92-P4 Bla-Mir-92-o4 Cel-Mir-92 Dan-Mir-92-P4 Dlo-Mir-92-P4 Dma-Mir-92-P4 Dmo-Mir-92-P4 Dpu-Mir-92-P4 Dsi-Mir-92-P4 Dya-Mir-92-P4 Esc-Mir-92 Gpa-Mir-92-P4 Gsp-Mir-92 Hme-Mir-92-P4 Hmi-Mir-92 Isc-Mir-92 Obi-Mir-92 Sme-Mir-92 Tca-Mir-92-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Pancrustacea | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Drosophila_melanogaster_BDGP6) |
3R: 25651416-25651478 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-92-P4) |
Mir-92-P3
3R: 25646522-25646581 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-92-P4 3R: 25651416-25651478 [+] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GCAGUGGUACAUUAAAACGUCACCUGAUGUAGGCCGUGCCCAGUGCUUAUUUGUUGCAUUUUCGAAAUACAAAUUGCACUAGUCCCGGCCUGCAAUGAGUGUCGCAGUCGACGAUCUACACAGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 GCAGUGGUACAUUAAAA-- U CU A U-| CC UU UUGCAUU CG CAC G UGUAGGCCG GC AGUGC AUUUG U GC GUG U ACGUCCGGC UG UCACG UAAAC U GACACAUCUAGCAGCUGAC U AG A CC^ A- U- AUAAAGC 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Dme-Mir-92-P4_5p* |
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mirBase accession | MIMAT0020819 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AGGCCGUGCCCAGUGCUUAUUUG -23
Get sequence
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Mature sequence | Dme-Mir-92-P4_3p |
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mirBase accession | MIMAT0000358 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
41- AAUUGCACUAGUCCCGGCCUGC -63
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000358 TargetScanFly: dme-miR-92b |