MirGeneDB ID | Dan-Mir-92-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-92 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AUUGCAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Fruit fly (Drosophila ananassae) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dan-mir-92b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Dan-Mir-92-P3 Dan-Mir-92-P5 Dan-Mir-92-P6 Dan-Mir-92-P7 Dan-Mir-92-P8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aae-Mir-92-P4 Aga-Mir-92-P4 Asu-Mir-92 Bfl-Mir-92-o4 Bge-Mir-92-P4 Bla-Mir-92-o4 Cel-Mir-92 Dlo-Mir-92-P4 Dma-Mir-92-P4 Dme-Mir-92-P4 Dmo-Mir-92-P4 Dpu-Mir-92-P4 Dsi-Mir-92-P4 Dya-Mir-92-P4 Esc-Mir-92 Gpa-Mir-92-P4 Gsp-Mir-92 Hme-Mir-92-P4 Hmi-Mir-92 Isc-Mir-92 Obi-Mir-92 Sme-Mir-92 Tca-Mir-92-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Pancrustacea | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Dana_caf1) |
scaffold_13340: 3732660-3732721 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-92-P4) |
Mir-92-P3
scaffold_13340: 3727792-3727850 [+]
Ensembl
Mir-92-P4 scaffold_13340: 3732660-3732721 [+] Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GCAGUGAAGCAUUAAAACGUCACCUGAUGUAGGCCGUGCCCGGUGCUUAUUUGUUACUUUUGGAAAUACAAAUUGCACUAGUCCCGGCCUGCAGUGAGUGUCAAAGGCAGCUAUCUUCACUGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 GCAGUGAAGCAUUAAAACG------| CUGA U- CC UU UUACUUU UCAC UGUAGGCCG GC GGUGC AUUUG \ AGUG ACGUCCGGC UG UCACG UAAAC U GUCACUUCUAUCGACGGAAACUGUG^ ---- CC A- U- AUAAAGG 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Dan-Mir-92-P4_5p* |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AGGCCGUGCCCGGUGCUUAUUUG -23
Get sequence
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Mature sequence | Dan-Mir-92-P4_3p |
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mirBase accession | MIMAT0008405 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
40- AAUUGCACUAGUCCCGGCCUGC -62
Get sequence
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