MirGeneDB ID | Dsi-Mir-92-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Family name | MIR-92 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AUUGCAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Fruit fly (Drosophila simulans) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dsi-mir-92b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Dsi-Mir-92-P3 Dsi-Mir-92-P5 Dsi-Mir-92-P6 Dsi-Mir-92-P7 Dsi-Mir-92-P8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aae-Mir-92-P4 Aga-Mir-92-P4 Asu-Mir-92 Bfl-Mir-92-o4 Bge-Mir-92-P4 Bla-Mir-92-o4 Cel-Mir-92 Dan-Mir-92-P4 Dlo-Mir-92-P4 Dma-Mir-92-P4 Dme-Mir-92-P4 Dmo-Mir-92-P4 Dpu-Mir-92-P4 Dya-Mir-92-P4 Esc-Mir-92 Gpa-Mir-92-P4 Gsp-Mir-92 Hme-Mir-92-P4 Hmi-Mir-92 Isc-Mir-92 Obi-Mir-92 Sme-Mir-92 Tca-Mir-92-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Pancrustacea | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Drosophila_simulans.ASM75419v3.dna.toplevel) |
3R: 20988469-20988531 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-92-P4) |
Mir-92-P3
3R: 20983536-20983595 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-92-P4 3R: 20988469-20988531 [+] UCSC Ensembl |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GCAGUGGUACAUUAAAACGUCACCUGAUGUAGGCCGUGCCCAGUGCUUAUUUGUUGCCUUUUCGAAAUACAAAUUGCACUAGUCCCGGCCUGCAGUGAGUGUCGCAGUCGACGAUCUACACAGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 GCAGUGGUACAUUAAAA-- U CUGA U-| CC UU UUGCCUU CG CAC UGUAGGCCG GC AGUGC AUUUG U GC GUG ACGUCCGGC UG UCACG UAAAC U GACACAUCUAGCAGCUGAC U AGUG CC^ A- U- AUAAAGC 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Star sequence | Dsi-Mir-92-P4_5p* |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AGGCCGUGCCCAGUGCUUAUUUG -23
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mature sequence | Dsi-Mir-92-P4_3p |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | MIMAT0008879 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
41- AAUUGCACUAGUCCCGGCCUGC -63
Get sequence
|