MirGeneDB ID | Dsi-Mir-92-P6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-92 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AUUGCAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Fruit fly (Drosophila simulans) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dsi-mir-311 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Dsi-Mir-92-P3 Dsi-Mir-92-P4 Dsi-Mir-92-P5 Dsi-Mir-92-P7 Dsi-Mir-92-P8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Asu-Mir-92 Bfl-Mir-92-o6 Bla-Mir-92-o6 Cel-Mir-92 Dan-Mir-92-P6 Dme-Mir-92-P6 Dmo-Mir-92-P6 Dya-Mir-92-P6a Dya-Mir-92-P6b Esc-Mir-92 Gsp-Mir-92 Hmi-Mir-92 Isc-Mir-92 Obi-Mir-92 Sme-Mir-92 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Drosophila | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Drosophila_simulans.ASM75419v3.dna.toplevel) |
2R: 16995943-16996003 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-92-P6) |
Mir-92-P5
2R: 16995821-16995880 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-92-P6 2R: 16995943-16996003 [-] UCSC Ensembl Mir-92-P7 2R: 16996101-16996160 [-] UCSC Ensembl Mir-92-P8 2R: 16996240-16996300 [-] UCSC Ensembl Mir-991 2R: 16997663-16997724 [-] UCSC Ensembl Mir-992 2R: 16997777-16997837 [-] UCSC Ensembl Mir-7 2R: 17018215-17018276 [+] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GUGAAAAAUCGAAAUUUCUAGAUCAUUUUUCGGACGGUAUAUGAGUCAAUAUUUUUUUUUUUUCGAAUAUAUUGCACAUUCACCGGCCUGAAAAUAUCAAGAAUUAGCAUCGAAAAAGAAAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 GUGAAAAAUCGAAAUUU---| A C C A AU A U UUUUUUU CU GAU AUUUUU GG CGGU AUG G CAAUAU U GA CUA UAAAAG CC GCCA UAC C GUUAUA U AAAGAAAAAGCUACGAUUAA^ A - U G CU A - UAAGCUU . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Dsi-Mir-92-P6_5p* |
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mirBase accession | MIMAT0037347 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CGGACGGUAUAUGAGUCAAUAUU -23
Get sequence
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Mature sequence | Dsi-Mir-92-P6_3p |
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mirBase accession | MIMAT0008857 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
39- UAUUGCACAUUCACCGGCCUGA -61
Get sequence
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