MirGeneDB ID | Dsi-Mir-92-P3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-92 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AUUGCAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Fruit fly (Drosophila simulans) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dsi-mir-92a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Dsi-Mir-92-P4 Dsi-Mir-92-P5 Dsi-Mir-92-P6 Dsi-Mir-92-P7 Dsi-Mir-92-P8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aae-Mir-92-P3 Aga-Mir-92-P3 Asu-Mir-92 Bfl-Mir-92-o3 Bge-Mir-92-P3 Bla-Mir-92-o3 Cel-Mir-92 Dan-Mir-92-P3 Dlo-Mir-92-P3 Dma-Mir-92-P3 Dme-Mir-92-P3 Dmo-Mir-92-P3 Dpu-Mir-92-P3 Dya-Mir-92-P3 Esc-Mir-92 Gpa-Mir-92-P3 Gsp-Mir-92 Hme-Mir-92-P3 Hmi-Mir-92 Isc-Mir-92 Obi-Mir-92 Sme-Mir-92 Tca-Mir-92-P3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Pancrustacea | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Drosophila_simulans.ASM75419v3.dna.toplevel) |
3R: 20983536-20983595 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-92-P3) |
Mir-92-P3
3R: 20983536-20983595 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-92-P4 3R: 20988469-20988531 [+] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UUCAGCCGAAUAAAAAUAUGAAUUUCCCGUAGGACGGGAAGGUGUCAACGUUUUGCAUUUCGAAUAAACAUUGCACUUGUCCCGGCCUAUGGGCGGUUUGUAAUAAACAACUAAAAUCAAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 UUCAGCCGAAUAAAAAU-- UG UU A -| U C UUGCAU A AAU CCCGUAGG CGGGA AGGUG CAA GUU U U UUG GGGUAUCC GCCCU UUCAC GUU CAA U AACUAAAAUCAACAAAUAA GU GC G G^ - A AUAAGC . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Dsi-Mir-92-P3_5p* |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AGGACGGGAAGGUGUCAACGUU -22
Get sequence
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Mature sequence | Dsi-Mir-92-P3_3p |
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mirBase accession | MIMAT0008898 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
38- CAUUGCACUUGUCCCGGCCUAU -60
Get sequence
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