MirGeneDB ID | Aga-Mir-92-P3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Family name | MIR-92 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AUUGCAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | African malaria mosquito (Anopheles gambiae) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | aga-mir-92a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Aga-Mir-92-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aae-Mir-92-P3 Asu-Mir-92 Bfl-Mir-92-o3 Bge-Mir-92-P3 Bla-Mir-92-o3 Cel-Mir-92 Dan-Mir-92-P3 Dlo-Mir-92-P3 Dma-Mir-92-P3 Dme-Mir-92-P3 Dmo-Mir-92-P3 Dpu-Mir-92-P3 Dsi-Mir-92-P3 Dya-Mir-92-P3 Esc-Mir-92 Gpa-Mir-92-P3 Gsp-Mir-92 Hme-Mir-92-P3 Hmi-Mir-92 Isc-Mir-92 Obi-Mir-92 Sme-Mir-92 Tca-Mir-92-P3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Pancrustacea | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCF_943734735.2_idAnoGambNW_F1_1_genomic) |
NC_064601.1: 38578027-38578084 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-92-P3) |
Mir-92-P3
NC_064601.1: 38578027-38578084 [+]
Ensembl
Mir-92-P4 NC_064601.1: 38592563-38592624 [+] Ensembl |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | ACUAGUCGAAUAAAAAUCAGGACUACGCGUCGGCCGGCUCAAGAGCAAAAUUGUGUUUCAUACUAAUAUUGCACUUGUCCCGGCCUAUGUGUGGUAAGGCCUGAAAAGCAUCAGUCUGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 ACUAGUCGAAUAAAAAUCAGG--| C CU A A GUGUU ACUACGCGU GGCCGG CAAG GCAA AUU U UGGUGUGUA CCGGCC GUUC CGUU UAA C GUCUGACUACGAAAAGUCCGGAA^ U CU A A UCAUA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Star sequence | Aga-Mir-92-P3_5p* |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CGGCCGGCUCAAGAGCAAAAUU -22
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mature sequence | Aga-Mir-92-P3_3p |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | MIMAT0001527 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
36- UAUUGCACUUGUCCCGGCCUAU -58
Get sequence
|