| MirGeneDB ID | Gpa-Mir-92-P3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-92 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AUUGCAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Tsetse fly (Glossina pallidipes) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Gpa-Mir-92-o62 Gpa-Mir-92-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-92-P3 Aga-Mir-92-P3 Asu-Mir-92 Bfl-Mir-92-o3 Bge-Mir-92-P3 Bla-Mir-92-o3 Cel-Mir-92 Dan-Mir-92-P3 Dlo-Mir-92-P3 Dma-Mir-92-P3 Dme-Mir-92-P3 Dmo-Mir-92-P3 Dpu-Mir-92-P3 Dsi-Mir-92-P3 Dya-Mir-92-P3 Esc-Mir-92 Gsp-Mir-92 Hme-Mir-92-P3 Hmi-Mir-92 Isc-Mir-92 Obi-Mir-92 Sme-Mir-92 Tca-Mir-92-P3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Pancrustacea | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GpalI1) |
Scaffold58: 1279284-1279346 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AAGGAAAAAACGUGUGUGUAAAUUGCAUUUAGGUGGGGAAAGGUGUCAAUGUUUUAGUGAAUACCAAUUAAUAUUGCACUUGUCCCGGCCUAUAAGCGAUUUAUCAGAAAAGUCAUCAUAAACGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 AAGGAAAAAACGUGUGU--| AUU G A U UUAGUGA GUAAAUUGC UAGGU GGGA AGGUG CAAUGUU A UAUUUAGCG AUCCG CCCU UUCAC GUUAUAA U CAAAUACUACUGAAAAGAC^ AAU G G - UUAACCA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Gpa-Mir-92-P3_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGGUGGGGAAAGGUGUCAAUGUU -23
Get sequence
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| Mature sequence | Gpa-Mir-92-P3_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
41- UAUUGCACUUGUCCCGGCCUAU -63
Get sequence
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