MirGeneDB ID | Dya-Mir-92-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-92 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AUUGCAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Fruit fly (Drosophila yakuba) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dya-mir-92b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Dya-Mir-92-P3 Dya-Mir-92-P5 Dya-Mir-92-P6a Dya-Mir-92-P6b Dya-Mir-92-P7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aae-Mir-92-P4 Aga-Mir-92-P4 Asu-Mir-92 Bfl-Mir-92-o4 Bge-Mir-92-P4 Bla-Mir-92-o4 Cel-Mir-92 Dan-Mir-92-P4 Dlo-Mir-92-P4 Dma-Mir-92-P4 Dme-Mir-92-P4 Dmo-Mir-92-P4 Dpu-Mir-92-P4 Dsi-Mir-92-P4 Esc-Mir-92 Gpa-Mir-92-P4 Gsp-Mir-92 Hme-Mir-92-P4 Hmi-Mir-92 Isc-Mir-92 Obi-Mir-92 Sme-Mir-92 Tca-Mir-92-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Pancrustacea | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Drosophila_yakuba.dyak_caf1.dna.toplevel) |
3R: 24996479-24996541 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-92-P4) |
Mir-92-P4
3R: 24996479-24996541 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-92-P3 3R: 25001394-25001453 [-] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GCAGUGGUACAUUAAAACGUCACCUGAUGUAGGCCGUGCCCAGUGCUUAUUUGUUGCCUUUUCGAAAUACAAAUUGCACUAGUCCCGGCCUGCAGUGAGUGUCGCAGUCAGCGAUCUGCACAGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 GCAGUGGUACAUUAAAA-- U CUGA U-| CC UU UUGCCUU CG CAC UGUAGGCCG GC AGUGC AUUUG U GC GUG ACGUCCGGC UG UCACG UAAAC U GACACGUCUAGCGACUGAC U AGUG CC^ A- U- AUAAAGC 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Dya-Mir-92-P4_5p* |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AGGCCGUGCCCAGUGCUUAUUUG -23
Get sequence
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Mature sequence | Dya-Mir-92-P4_3p |
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mirBase accession | MIMAT0009120 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
41- AAUUGCACUAGUCCCGGCCUGC -63
Get sequence
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