MirGeneDB ID | Hsa-Mir-3144-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-3144 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GGGGACC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Human (Homo sapiens) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | hsa-mir-3144 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Hsa-Mir-3144-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Pab-Mir-3144 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Catarrhini | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Catarrhini | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (hg38) |
chr6: 120015191-120015247 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-3144-v2) |
Mir-3144-v1
chr6: 120015190-120015248 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-3144-v2 chr6: 120015191-120015247 [+] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AGGAAAACAUCAGACUGAAACUACACUUUAAGGGGACCAAAGAGAUAUAUAGAUAUCAGCUACCUAUAUACCUGUUCGGUCUCUUUAAAGUGUAGUUUAACUGAUUUUUUAAUGGAUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 AGGAAAACAUCAGACUG--| A G A GAUAUC AAACUACACUUUAAGGGGACC AA AG UAUAUA \ UUUGAUGUGAAAUUUCUCUGG UU UC AUAUAU A UAGGUAAUUUUUUAGUCAA^ C G C CCAUCG 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Hsa-Mir-3144-v2_5p |
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mirBase accession | MIMAT0015014 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AGGGGACCAAAGAGAUAUAUA -21
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0015014 TargetScanVert: hsa-miR-3144-5p TargetMiner: hsa-miR-3144-5p miRDB: MIMAT0015014 |
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Star sequence | Hsa-Mir-3144-v2_3p* |
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mirBase accession | MIMAT0015015 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
36- UAUACCUGUUCGGUCUCUUUA -57
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0015015 TargetScanVert: hsa-miR-3144-3p TargetMiner: hsa-miR-3144-3p miRDB: MIMAT0015015 |