MirGeneDB ID | Lan-Mir-193-P1p | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-193 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | ACUGGCC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Lingula (Lingula anatina) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Lan-Mir-193-P1q Lan-Mir-193-P2p Lan-Mir-193-P2q | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aae-Mir-193-P1 Bge-Mir-193-P1 Cbr-Mir-193-P1-v1 Cbr-Mir-193-P1-v2 Cel-Mir-193-P1-v1 Cel-Mir-193-P1-v2 Cgi-Mir-193-P1 Cte-Mir-193-P1 Dan-Mir-193-P1-v1 Dan-Mir-193-P1-v2 Dan-Mir-193-P1-v3 Dan-Mir-193-P1-v4 Dma-Mir-193-P1 Dme-Mir-193-P1-v1 Dme-Mir-193-P1-v2 Dme-Mir-193-P1-v3 Dme-Mir-193-P1-v4 Dmo-Mir-193-P1-v1 Dmo-Mir-193-P1-v2 Dmo-Mir-193-P1-v3 Dmo-Mir-193-P1-v4 Dpu-Mir-193-P1 Dsi-Mir-193-P1-v1 Dsi-Mir-193-P1-v2 Dsi-Mir-193-P1-v3 Dsi-Mir-193-P1-v4 Dya-Mir-193-P1-v1 Dya-Mir-193-P1-v2 Dya-Mir-193-P1-v3 Dya-Mir-193-P1-v4 Esc-Mir-193-P1 Hme-Mir-193-P1 Isc-Mir-193-P1 Lgi-Mir-193-P1 Npo-Mir-193-P1 Obi-Mir-193-P1 Ovu-Mir-193-P1 Pma-Mir-193-P1 Pmi-Mir-193-P1 Tca-Mir-193-P1 Xbo-Mir-193-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (LinAna_1.0) |
LFEI01000500: 127748-127808 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AACAGUACGGGCUACACGUCCUCUCUCAUCAGGGAGUUUGCUCGCCAUGCUUAUGGCUCUGAACCUAUAAACUGGCCUGCAAAAUCCCUUCUGACGUGGGGACAUUGAGCAAACCCGUGAUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 AACAGUACGGGCUACAC- UC-| UC G UC UGCUUAUGGCUC GUCCUC UCA AGGGA UUUGC GCCA \ CAGGGG AGU UCCCU AAACG CGGU U UAGUGCCCAAACGAGUUA UGC^ CU A UC CAAAUAUCCAAG . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Lan-Mir-193-P1p_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AGGGAGUUUGCUCGCCAUGCUUA -23
Get sequence
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Mature sequence | Lan-Mir-193-P1p_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
39- AACUGGCCUGCAAAAUCCCUUC -61
Get sequence
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