MirGeneDB 2.1
MirGeneDB ID

Tca-Mir-193-P1

Family name MIR-193 (all species)
Seed ACUGGCC
Species Red flour beetle (Tribolium castaneum)
MiRBase ID tca-mir-193
Paralogues Tca-Mir-193-P2 
Orthologues Aae-Mir-193-P1  Aca-Mir-193-P1b  Ami-Mir-193-P1a  Ami-Mir-193-P1b  Bfl-Mir-193-P1e  Bfl-Mir-193-P1j  Bfl-Mir-193-P1k  Bfl-Mir-193-P1o1a  Bfl-Mir-193-P1o1b  Bfl-Mir-193-P1o2  Bge-Mir-193-P1  Bla-Mir-193-P1e  Bla-Mir-193-P1f1  Bla-Mir-193-P1f2  Bla-Mir-193-P1g1  Bla-Mir-193-P1g2  Bla-Mir-193-P1h1  Bla-Mir-193-P1h2  Bla-Mir-193-P1i1  Bla-Mir-193-P1i2  Bla-Mir-193-P1j1  Bla-Mir-193-P1j2  Bla-Mir-193-P1k  Bta-Mir-193-P1a  Bta-Mir-193-P1b  Cbr-Mir-193-P1-v1  Cbr-Mir-193-P1-v2  Cel-Mir-193-P1-v1  Cel-Mir-193-P1-v2  Cfa-Mir-193-P1a  Cfa-Mir-193-P1b  Cgi-Mir-193-P1  Cli-Mir-193-P1a  Cmi-Mir-193-P1a  Cmi-Mir-193-P1b  Cpi-Mir-193-P1a  Cpi-Mir-193-P1b  Cpo-Mir-193-P1a  Cpo-Mir-193-P1b  Csc-Mir-193-P1u  Cte-Mir-193-P1  Dan-Mir-193-P1-v1  Dan-Mir-193-P1-v2  Dan-Mir-193-P1-v3  Dan-Mir-193-P1-v4  Dma-Mir-193-P1  Dme-Mir-193-P1-v1  Dme-Mir-193-P1-v2  Dme-Mir-193-P1-v3  Dme-Mir-193-P1-v4  Dmo-Mir-193-P1-v1  Dmo-Mir-193-P1-v2  Dmo-Mir-193-P1-v3  Dmo-Mir-193-P1-v4  Dno-Mir-193-P1a  Dno-Mir-193-P1b  Dpu-Mir-193-P1  Dre-Mir-193-P1a  Dre-Mir-193-P1b1  Dre-Mir-193-P1b2  Dsi-Mir-193-P1-v1  Dsi-Mir-193-P1-v2  Dsi-Mir-193-P1-v3  Dsi-Mir-193-P1-v4  Dya-Mir-193-P1-v1  Dya-Mir-193-P1-v2  Dya-Mir-193-P1-v3  Dya-Mir-193-P1-v4  Efe-Mir-193-P1n  Efe-Mir-193-P1o  Esc-Mir-193-P1  Ete-Mir-193-P1a  Ete-Mir-193-P1b  Gga-Mir-193-P1a  Gga-Mir-193-P1b  Gja-Mir-193-P1b  Gmo-Mir-193-P1b2  Hme-Mir-193-P1  Hsa-Mir-193-P1a  Hsa-Mir-193-P1b  Isc-Mir-193-P1  Lan-Mir-193-P1p  Lan-Mir-193-P1q  Lch-Mir-193-P1a  Lch-Mir-193-P1b  Lgi-Mir-193-P1  Loc-Mir-193-P1a  Loc-Mir-193-P1b  Loc-Mir-193-P1b-as  Lpo-Mir-193-P1r  Lpo-Mir-193-P1s  Lpo-Mir-193-P1t  Mal-Mir-193-P1b2  Mdo-Mir-193-P1a  Mdo-Mir-193-P1b  Mml-Mir-193-P1a  Mml-Mir-193-P1b  Mmu-Mir-193-P1a  Mmu-Mir-193-P1b  Mun-Mir-193-P1a  Mun-Mir-193-P1b  Npo-Mir-193-P1  Oan-Mir-193-P1a  Oan-Mir-193-P1b  Obi-Mir-193-P1  Ocu-Mir-193-P1a  Ocu-Mir-193-P1b  Ovu-Mir-193-P1  Pbv-Mir-193-P1a  Pbv-Mir-193-P1b  Pfl-Mir-193-P1c  Pfl-Mir-193-P1d  Pma-Mir-193-P1  Pmi-Mir-193-P1  Rno-Mir-193-P1a  Rno-Mir-193-P1b  Sha-Mir-193-P1a  Sha-Mir-193-P1b  Sko-Mir-193-P1c  Sko-Mir-193-P1d  Spt-Mir-193-P1a  Spt-Mir-193-P1b  Sto-Mir-193-P1a  Sto-Mir-193-P1b  Tgu-Mir-193-P1a  Tgu-Mir-193-P1b  Tni-Mir-193-P1b2  Xbo-Mir-193-P1  Xla-Mir-193-P1a3  Xla-Mir-193-P1a4  Xtr-Mir-193-P1a 
Node of Origin (locus) Bilateria
Node of Origin (family) Bilateria
Genome context
(Tcas5.2)		 LG8: 5228763-5228819 [-] Ensembl
Clustered miRNAs
(< 50kb from Mir-193-P1)		 Mir-193-P2 LG8: 5228629-5228689 [-] Ensembl
Mir-193-P1 LG8: 5228763-5228819 [-] Ensembl
Precursor
(pre-Mir +30nt flank)
GAGGGCAGCAGCAAACUGGUCGUAAUGGUUUGGGCCUUAUAGGUUCAGUUGAUCAUUUUUAAAGCUACUGGCCUGUUAAGUCCCAAGUUAUUACAUUGCCGGAAGCUUCAGACUUCG
Get precursor sequence
Structure
        10        20          30         40        50        
GAGGGCAGCAGCAAACUGGUC--     GG      C   -|     U    UGAUCAUU 
                       GUAAU  UUUGGG CUU AUAGGU CAGU        \
                       CAUUA  GAACCC GAA UGUCCG GUCA        U
GCUUCAGACUUCGAAGGCCGUUA     UU      U   U^     -    UCGAAAUU 
     110       100        90        80         70        60
Deep sequencing
Go to detailed chart
3' NTU No
MotifsUG at 5p(-14)
Tissue expression
-   +
Ad Ea Em Em Em Em Em Fe Fe Fe Fe Oo
Star sequence

Tca-Mir-193-P1_5p*
mirBase accessionMIMAT0018896
Sequence 
0- UGGGCCUUAUAGGUUCAGUUGA -22
Get sequence
Mature sequence

Tca-Mir-193-P1_3p
mirBase accessionMIMAT0018897
Sequence 
35- UACUGGCCUGUUAAGUCCCAAG -57
Get sequence