MirGeneDB 3.0
192 Tribolium castaneum microRNA genes
Sort by genome coordinates Motifs Tissue expression
-   +
MirGeneDB ID ▲ MiRBase ID Family Seed 5p accession 3p accession Chromosome Start End Strand Node of origin (locus) Node of origin (family) 3' NTU  UG  UGUG CNNC Ad Ea Em Em Em Em Em Fe Fe Fe Fe Oo
Tca-Bantam tca-bantam BANTAM GAGAUCA MIMAT0019178 MIMAT0010091 LG3 16990366 16990425 + Protostomia Protostomia No
Tca-Iab-4 tca-mir-iab-4 IAB-4 CGUAUAC MIMAT0008393 MIMAT0008394 LG2 7972007 7972063 - Arthropoda Arthropoda No 1 1
Tca-Iab-4-as tca-mir-iab-8 IAB-4 GGAUACA MIMAT0018698 MIMAT0018699 LG2 7972007 7972066 + Pancrustacea Arthropoda No
Tca-Let-7 tca-let-7 LET-7 GAGGUAG MIMAT0008354 MIMAT0019098 LG6 4363426 4363492 + Bilateria Bilateria No 1 1
Tca-Mir-1 tca-mir-1 MIR-1 GGAAUGU MIMAT0019092 MIMAT0008352 LG5 10584667 10584724 - Bilateria Bilateria No 1
Tca-Mir-2-P1-v1 tca-mir-2-3 MIR-2 CACAGCC MIMAT0019093 MIMAT0008353 LG3 560832 560890 + Arthropoda Protostomia No 1
Tca-Mir-2-P1-v2 tca-mir-2-3 MIR-2 AUCACAG MIMAT0019093 MIMAT0008353 LG3 560833 560889 + Arthropoda Protostomia No 1
Tca-Mir-2-P2a tca-mir-13a MIR-2 AUCACAG MIMAT0019103 MIMAT0008359 LG3 560954 561011 + Neoptera Protostomia No 1 1
Tca-Mir-2-P2b tca-mir-13b MIR-2 AUCACAG MIMAT0019104 MIMAT0008360 LG3 561066 561124 + Neoptera Protostomia No 1
Tca-Mir-2-P3-v1 tca-mir-2-1 MIR-2 AUCACAG MIMAT0019094 MIMAT0008353 LG3 561200 561258 + Arthropoda Protostomia No 1
Tca-Mir-2-P3-v2 tca-mir-2-1 MIR-2 CACAGCC MIMAT0019094 MIMAT0008353 LG3 561198 561260 + Arthropoda Protostomia No 1
Tca-Mir-2-P4-v1 tca-mir-2-2 MIR-2 AUCACAG MIMAT0019096 MIMAT0008353 LG3 561350 561410 + Arthropoda Protostomia No 1 1
Tca-Mir-2-P4-v2 tca-mir-2-2 MIR-2 CACAGCC MIMAT0019096 MIMAT0008353 LG3 561348 561412 + Arthropoda Protostomia No 1
Tca-Mir-2-P5c tca-mir-2944a MIR-2 AUCACAG MIMAT0018718 MIMAT0018719 LG3 15689938 15689994 + T. castaneum Protostomia No 1
Tca-Mir-2-P5d tca-mir-2944b MIR-2 AAGGAAC MIMAT0018746 MIMAT0018747 LG5 7455840 7455901 + T. castaneum Protostomia No 1
Tca-Mir-2-P5e tca-mir-2944c MIR-2 AUCACAG MIMAT0018810 MIMAT0018811 LG9 10977 11036 - T. castaneum Protostomia No 1
Tca-Mir-2-P7 tca-mir-11 MIR-2 AUCACAG MIMAT0018854 MIMAT0018855 LG5 7197519 7197576 + Neoptera Protostomia No 1 1
Tca-Mir-2-P8 tca-mir-308 MIR-2 AUCACAG MIMAT0018706 MIMAT0018707 LG2 4737006 4737062 - Aparaglossata Protostomia No 1 1
Tca-Mir-3-P4 tca-mir-309a MIR-3 GAUGAAC MIMAT0018750 MIMAT0018751 LG5 7455958 7456014 + T. castaneum Pancrustacea No 1
Tca-Mir-3-P5 tca-mir-309b MIR-3 CACUGGG MIMAT0018886 MIMAT0018887 LG5 7457453 7457508 + T. castaneum Pancrustacea No 1 1
Tca-Mir-3-P6 tca-mir-309c MIR-3 CACUGGG MIMAT0045526 MIMAT0045527 LG5 7457335 7457391 + T. castaneum Pancrustacea No 1
Tca-Mir-3-P7-v1 None MIR-3 CACUGGG None None LG2 364450 364510 - T. castaneum Pancrustacea No 1
Tca-Mir-3-P7-v2 None MIR-3 ACUGGGC None None LG2 364450 364510 - T. castaneum Pancrustacea No 1
Tca-Mir-3-P8 None MIR-3 CACUGGG None None LG2 1143938 1143997 + T. castaneum Pancrustacea No 1
Tca-Mir-3-P9a None MIR-3 CACUGGG None None LG2 342886 342945 - T. castaneum Pancrustacea No 1
Tca-Mir-3-P9b None MIR-3 CACUGGG None None KQ971812 4156 4215 - T. castaneum Pancrustacea No 1
Tca-Mir-3-P10 None MIR-3 CACUGGG None None LG2 1144355 1144413 + T. castaneum Pancrustacea No 1
Tca-Mir-3-P11 None MIR-3 GGUCUAU None None LG2 1140475 1140533 + T. castaneum Pancrustacea No
Tca-Mir-3-P12a None MIR-3 CACUGGG None None KQ972170 29279 29337 + T. castaneum Pancrustacea No 1
Tca-Mir-3-P12b None MIR-3 CACUGGG None None KQ972170 8053 8111 - T. castaneum Pancrustacea No 1
Tca-Mir-3-P13a None MIR-3 CACUGGG None None LG2 1145669 1145727 + T. castaneum Pancrustacea No 1
Tca-Mir-3-P13b None MIR-3 CACUGGG None None LG2 1141776 1141834 + T. castaneum Pancrustacea No 1
Tca-Mir-7 tca-mir-7 MIR-7 GGAAGAC MIMAT0008355 MIMAT0019099 LG7 1856524 1856585 + Bilateria Bilateria No 1 1
Tca-Mir-8 tca-mir-8 MIR-8 AAUACUG MIMAT0019100 MIMAT0008356 LG9 8781913 8781973 - Nephrozoa Nephrozoa No 1
Tca-Mir-9-P9a tca-mir-9c MIR-9 CUUUGGU MIMAT0018714 MIMAT0018715 LG3 15689817 15689876 + T. castaneum Bilateria No 1
Tca-Mir-9-P9b-v1 tca-mir-9d MIR-9 UAAAGCU MIMAT0018748 MIMAT0018749 LG5 7455728 7455787 + T. castaneum Bilateria No 1
Tca-Mir-9-P9b-v2 tca-mir-9d MIR-9 AAAGCUA MIMAT0018748 MIMAT0018749 LG5 7455728 7455788 + T. castaneum Bilateria No 1
Tca-Mir-9-P9c-v1 tca-mir-9e MIR-9 CUUUGGU MIMAT0023581 MIMAT0023582 LG9 11087 11146 - T. castaneum Bilateria No 1 1
Tca-Mir-9-P9c-v2 tca-mir-9e MIR-9 UUUGGUG MIMAT0023581 MIMAT0023582 LG9 11088 11145 - T. castaneum Bilateria No 1 1
Tca-Mir-9-P10 tca-mir-9a MIR-9 CUUUGGU MIMAT0010090 MIMAT0019177 LGX 6011261 6011324 - Pancrustacea Bilateria No 1 1
Tca-Mir-9-P12 tca-mir-9b MIR-9 UUUGGUA MIMAT0019134 MIMAT0019135 KQ972687 113154 113211 - Neoptera Bilateria No 1
Tca-Mir-10-P1-v1 tca-mir-10 MIR-10 CCCUGUA MIMAT0008357 MIMAT0019101 LG2 8460384 8460441 + Bilateria Eumetazoa No 1
Tca-Mir-10-P1-v2 tca-mir-10 MIR-10 ACCCUGU MIMAT0008357 MIMAT0019101 LG2 8460383 8460442 + Bilateria Eumetazoa No 1
Tca-Mir-10-P2 tca-mir-100 MIR-10 ACCCGUA MIMAT0008369 MIMAT0019113 LG6 4363294 4363349 + Bilateria Eumetazoa No 1
Tca-Mir-10-P3 tca-mir-125 MIR-10 CCCUGAG MIMAT0008371 MIMAT0019115 LG6 4363618 4363677 + Bilateria Eumetazoa No 1
Tca-Mir-10-P4 tca-mir-993 MIR-10 AAGCUCG MIMAT0019182 MIMAT0010094 LG2 8499393 8499454 - Protostomia Eumetazoa No
Tca-Mir-12 tca-mir-12 MIR-12 GAGUAUU MIMAT0008358 MIMAT0019102 LG3 21686059 21686118 - Protostomia Protostomia No 1
Tca-Mir-14 tca-mir-14 MIR-14 CAGUCUU MIMAT0019105 MIMAT0008361 LG3 2833776 2833833 + Neoptera Neoptera No 1
Tca-Mir-22-P2-v1 tca-mir-980 MIR-22 GGCUCGU MIMAT0018864 MIMAT0018865 KQ972119 1428 1488 + Bilateria Bilateria No 1 1
Tca-Mir-22-P2-v2 tca-mir-980 MIR-22 GCUCGUC MIMAT0018864 MIMAT0018865 KQ972119 1429 1486 + Bilateria Bilateria No 1 1
Tca-Mir-29-P1 tca-mir-29 MIR-29 AGCACCA MIMAT0018802 MIMAT0018803 LG9 3035860 3035918 + Bilateria Bilateria No
Tca-Mir-29-P2g tca-mir-995 MIR-29 AGCACCA MIMAT0018628 MIMAT0018629 LG10 5002382 5002440 + Neoptera Bilateria No 1
Tca-Mir-29-P2h tca-mir-998 MIR-29 ACUGAAU MIMAT0018852 MIMAT0018853 LG5 7197706 7197758 + Neoptera Bilateria No
Tca-Mir-31 tca-mir-31 MIR-31 GGCAAGA MIMAT0008362 MIMAT0019106 LG7 5938429 5938486 + Bilateria Bilateria No 1
Tca-Mir-33 tca-mir-33 MIR-33 UGCAUUG MIMAT0008363 MIMAT0019107 LG4 8315299 8315354 - Bilateria Bilateria No 1 1
Tca-Mir-34 tca-mir-34 MIR-34 GGCAGUG MIMAT0008364 MIMAT0019108 LG7 14503147 14503205 + Bilateria Bilateria No 1
Tca-Mir-36 tca-mir-3791 MIR-36 CACCGGG MIMAT0018882 MIMAT0018883 LG5 7457551 7457607 + Protostomia Protostomia No 1
Tca-Mir-67-v1 tca-mir-307 MIR-67 CACAACC MIMAT0019129 MIMAT0008389 LG8 13556470 13556530 + Protostomia Protostomia No 1
Tca-Mir-67-v2 tca-mir-307 MIR-67 ACAACCU MIMAT0019129 MIMAT0008389 LG8 13556470 13556530 + Protostomia Protostomia No 1
Tca-Mir-67-v3 tca-mir-307 MIR-67 CAACCUC MIMAT0019129 MIMAT0008389 LG8 13556470 13556530 + Protostomia Protostomia No 1
Tca-Mir-71 tca-mir-71 MIR-71 CUCACUA MIMAT0008365 MIMAT0019109 LG3 560714 560776 + Nephrozoa Nephrozoa No 1
Tca-Mir-76 tca-mir-981 MIR-76 UCGUUGU None MIMAT0010098 LG4 3688104 3688160 + Nephrozoa Nephrozoa No 1
Tca-Mir-87-P1 tca-mir-87a MIR-87 UGAGCAA MIMAT0019110 MIMAT0008366 LG6 1499347 1499408 + Protostomia Protostomia No 1 1 1
Tca-Mir-87-P2 tca-mir-87b MIR-87 UGAGCAA MIMAT0018768 MIMAT0018769 LG6 1502215 1502272 + Protostomia Protostomia No 1 1
Tca-Mir-92-P3 tca-mir-92a MIR-92 AUUGCAC MIMAT0019111 MIMAT0008367 LG8 3039003 3039061 + Pancrustacea Bilateria No 1
Tca-Mir-92-P4 tca-mir-92b MIR-92 AUUGCAC MIMAT0019112 MIMAT0008368 LG8 3039554 3039615 + Pancrustacea Bilateria No 1
Tca-Mir-92-P14 tca-mir-92c MIR-92 AUUGCAC MIMAT0018786 MIMAT0018787 LG7 1817556 1817612 + Neoptera Bilateria No 1 1
Tca-Mir-96-P2 tca-mir-263b MIR-96 UUGGCAC MIMAT0008378 MIMAT0019122 LG3 4855287 4855345 + Bilateria Bilateria No
Tca-Mir-96-P3 tca-mir-263a MIR-96 AUGGCAC MIMAT0010093 MIMAT0019180 LG5 13500413 13500472 - Bilateria Bilateria No 1
Tca-Mir-124 tca-mir-124 MIR-124 AAGGCAC MIMAT0019114 MIMAT0008370 LG5 13734458 13734515 - Bilateria Bilateria No
Tca-Mir-133 tca-mir-133 MIR-133 UGGUCCC MIMAT0019116 MIMAT0008372 LG5 10558226 10558282 - Bilateria Bilateria No 1 1
Tca-Mir-137-v1 tca-mir-137 MIR-137 UAUUGCU MIMAT0019117 MIMAT0008373 LG7 3734620 3734680 + Bilateria Bilateria No 1
Tca-Mir-137-v2 tca-mir-137 MIR-137 AUUGCUU MIMAT0019117 MIMAT0008373 LG7 3734620 3734680 + Bilateria Bilateria No 1
Tca-Mir-184 tca-mir-184 MIR-184 GGACGGA MIMAT0019118 MIMAT0008374 LG7 12944304 12944360 + Nephrozoa Nephrozoa No 1
Tca-Mir-190 tca-mir-190 MIR-190 GAUAUGU MIMAT0008375 MIMAT0019119 LG7 945898 945956 + Bilateria Bilateria No 1 1
Tca-Mir-193-P1 tca-mir-193 MIR-193 ACUGGCC MIMAT0018896 MIMAT0018897 LG8 5228763 5228819 - Bilateria Bilateria No 1
Tca-Mir-193-P2 tca-mir-2788 MIR-193 AAUGCCC MIMAT0018798 MIMAT0018799 LG8 5228629 5228689 - Bilateria Bilateria No
Tca-Mir-210-v1 tca-mir-210 MIR-210 UGUGCGU MIMAT0019120 MIMAT0008376 LG4 7127336 7127398 - Bilateria Bilateria No 1
Tca-Mir-210-v2 tca-mir-210 MIR-210 UUGUGCG MIMAT0019120 MIMAT0008376 LG4 7127336 7127398 - Bilateria Bilateria No 1
Tca-Mir-216-P1 tca-mir-283 MIR-216 AAUAUCA MIMAT0008387 MIMAT0019127 LG3 21690388 21690444 - Nephrozoa Nephrozoa No 1
Tca-Mir-216-P2 tca-mir-3477 MIR-216 AAUCUCA MIMAT0018736 MIMAT0018737 LG3 21686284 21686342 - Nephrozoa Nephrozoa No 1
Tca-Mir-219 tca-mir-219 MIR-219 GAUUGUC MIMAT0008377 MIMAT0019121 LG3 5656978 5657037 + Bilateria Bilateria No 1
Tca-Mir-252-P1 tca-mir-252b MIR-252 UAAGUAG MIMAT0018806 MIMAT0018807 LG9 7050461 7050518 + Bilateria Bilateria No 1 1
Tca-Mir-252-P2 tca-mir-252a MIR-252 UAAGUAC MIMAT0018804 MIMAT0018805 LG9 7058373 7058428 + Bilateria Bilateria No
Tca-Mir-275 tca-mir-275 MIR-275 CAGGUAC MIMAT0019123 MIMAT0008379 LG9 11129838 11129898 - Arthropoda Arthropoda No 1
Tca-Mir-276 tca-mir-276 MIR-276 AGGAACU MIMAT0008380 MIMAT0008381 LG3 12483938 12483995 - Arthropoda Arthropoda No 1
Tca-Mir-276-as tca-mir-276b MIR-276 AGGAACU MIMAT0045604 MIMAT0045605 LG3 12483940 12483997 + T. castaneum Arthropoda No 1
Tca-Mir-277 tca-mir-277 MIR-277 AAAUGCA MIMAT0019124 MIMAT0008382 LG7 14498469 14498537 + Protostomia Protostomia No 1
Tca-Mir-279-o3 tca-mir-279b MIR-279 GACUAGA MIMAT0019181 MIMAT0010201 LG5 444013 444072 + T. castaneum Protostomia No
Tca-Mir-279-P1c tca-mir-279c MIR-279 GACUAGA MIMAT0018730 MIMAT0018731 LG3 15690069 15690126 + T. castaneum Protostomia No 1
Tca-Mir-279-P1d tca-mir-279e MIR-279 GACUAGA MIMAT0018816 MIMAT0018817 LG9 11214 11274 - T. castaneum Protostomia No 1
Tca-Mir-279-P2 tca-mir-279a MIR-279 GACUAGA MIMAT0019125 MIMAT0008383 LG7 8213635 8213695 - Pancrustacea Protostomia No 1
Tca-Mir-279-P3 tca-mir-279d MIR-279 GGCGAUU MIMAT0018788 MIMAT0018789 LG7 8213507 8213566 - Pancrustacea Protostomia No 1
Tca-Mir-281 tca-mir-281 MIR-281 AGAGAGC MIMAT0008384 MIMAT0008385 LG7 203928 203983 + Nephrozoa Nephrozoa No 1
Tca-Mir-282 tca-mir-282 MIR-282 AGCCUCU MIMAT0008386 MIMAT0019126 LG7 12681808 12681866 - Pancrustacea Pancrustacea No 1
Tca-Mir-305 tca-mir-305 MIR-305 UUGUACU MIMAT0008388 MIMAT0019128 LG9 11129702 11129760 - Cryptovermes Cryptovermes No 1
Tca-Mir-315 tca-mir-315 MIR-315 UUUGAUU MIMAT0010096 None LGX 1327607 1327665 - Nephrozoa Nephrozoa No 1
Tca-Mir-316 tca-mir-316 MIR-316 GUCUUUU MIMAT0018716 MIMAT0018717 LG3 998672 998731 + Pancrustacea Pancrustacea No 1
Tca-Mir-317 tca-mir-317 MIR-317 GAACACA MIMAT0019130 MIMAT0008390 LG7 14490230 14490291 + Protostomia Protostomia No 1
Tca-Mir-375 tca-mir-375 MIR-375 UUGUUCG MIMAT0018794 MIMAT0018795 LG8 13678592 13678651 - Nephrozoa Nephrozoa No 1
Tca-Mir-750 tca-mir-750 MIR-750 CAGAUCU MIMAT0018820 MIMAT0018821 LG4 9452255 9452313 + Protostomia Protostomia No 1
Tca-Mir-927-P1 tca-mir-927a MIR-927 UUAGAAU MIMAT0008391 MIMAT0019131 LG9 12073274 12073331 + Neoptera Neoptera No 1 1
Tca-Mir-927-P2 tca-mir-927b MIR-927 UUAGAAU MIMAT0023579 MIMAT0023580 LG9 11684286 11684344 - Neoptera Neoptera No 1 1
Tca-Mir-929 tca-mir-929 MIR-929 AUUGACU MIMAT0008395 MIMAT0019133 LG9 8050350 8050407 + Neoptera Neoptera No
Tca-Mir-932 tca-mir-932 MIR-932 CAAUUCC MIMAT0008392 MIMAT0019132 LG5 14056897 14056957 - Neoptera Neoptera No 1
Tca-Mir-965 tca-mir-965 MIR-965 AAGCGUA MIMAT0019183 MIMAT0010095 LG5 8315316 8315375 + Pancrustacea Pancrustacea No 1
Tca-Mir-970 tca-mir-970 MIR-970 CAUAAGA MIMAT0019179 MIMAT0010092 LG2 10959586 10959647 + Aparaglossata Aparaglossata No 1
Tca-Mir-971 tca-mir-971b MIR-971 CACUCUA MIMAT0045561 MIMAT0045562 LG4 238976 239037 + Neoptera Neoptera No 1 1
Tca-Mir-989 tca-mir-989 MIR-989 GUGAUGU MIMAT0018822 MIMAT0018823 LG4 352055 352112 - Endopterygota Endopterygota No 1
Tca-Mir-1000 tca-mir-1000 MIR-1000 UAUUGUC MIMAT0010097 MIMAT0019184 LG2 3329648 3329705 + Neoptera Neoptera No 1
Tca-Mir-1175 tca-mir-1175 MIR-1175 GAGAUUC MIMAT0018818 MIMAT0018819 LG4 9452407 9452465 + Protostomia Protostomia No 1
Tca-Mir-2765 tca-mir-2765 MIR-2765 GGUAACU MIMAT0018630 MIMAT0018631 LG10 4187816 4187873 - Neoptera Neoptera No 1
Tca-Mir-2796 tca-mir-2796 MIR-2796 UAGGCCG MIMAT0018712 MIMAT0018713 LG2 14711038 14711098 - Neoptera Neoptera No 1
Tca-Mir-3049 tca-mir-3049 MIR-3049 CGGGAAG MIMAT0018776 MIMAT0018777 LG6 4828785 4828843 + Neoptera Neoptera No 1
Tca-Mir-3809 tca-mir-3809 MIR-3809 UCAUAAC MIMAT0018640 MIMAT0018641 LGX 6585862 6585919 + T. castaneum T. castaneum No 1
Tca-Mir-3811-P1 tca-mir-3811a-1 MIR-3811 AUGUACA MIMAT0018684 MIMAT0018645 LGX 6596442 6596505 + T. castaneum T. castaneum No 1
Tca-Mir-3811-P2a tca-mir-3811a-2 MIR-3811 UCUUGCU MIMAT0018644 MIMAT0018645 LGX 6597433 6597496 + T. castaneum T. castaneum No 1
Tca-Mir-3811-P2b tca-mir-3811a-4 MIR-3811 UCUUGCU MIMAT0018644 MIMAT0018645 LGX 6597098 6597161 + T. castaneum T. castaneum No 1
Tca-Mir-3811-P3 tca-mir-3811a-3 MIR-3811 AUGUACA MIMAT0018650 MIMAT0018645 LGX 6597762 6597824 + T. castaneum T. castaneum No 1
Tca-Mir-3811-P4 tca-mir-3811b MIR-3811 AUGUACA MIMAT0018664 MIMAT0018665 LGX 6598335 6598398 + T. castaneum T. castaneum No 1
Tca-Mir-3811-P5 tca-mir-3806 MIR-3811 UCUGUUC MIMAT0018634 MIMAT0018635 LGX 6598547 6598608 + T. castaneum T. castaneum No 1
Tca-Mir-3811-P6 tca-mir-3808 MIR-3811 CAUAUUC MIMAT0018638 MIMAT0018639 LGX 6595867 6595926 + T. castaneum T. castaneum No 1
Tca-Mir-3814 tca-mir-3814 MIR-3814 AGCAUGA MIMAT0018652 MIMAT0018653 LGX 6587955 6588013 + T. castaneum T. castaneum No 1
Tca-Mir-3816-v1 tca-mir-3816 MIR-3816 UGCUGCC MIMAT0018656 MIMAT0018657 LGX 6594971 6595029 + T. castaneum T. castaneum No 1
Tca-Mir-3816-v2 tca-mir-3816 MIR-3816 GCUGCCA MIMAT0018656 MIMAT0018657 LGX 6594971 6595029 + T. castaneum T. castaneum No 1
Tca-Mir-3820 tca-mir-3820 MIR-3820 UUGCCAA MIMAT0018666 MIMAT0018667 LGX 6587625 6587682 + T. castaneum T. castaneum No 1
Tca-Mir-3821-v1 tca-mir-3821 MIR-3821 UUCUAGU MIMAT0018668 MIMAT0018669 LGX 6586315 6586372 + T. castaneum T. castaneum No 1
Tca-Mir-3821-v2 tca-mir-3821 MIR-3821 UUUCUAG MIMAT0018668 MIMAT0018669 LGX 6586315 6586372 + T. castaneum T. castaneum No 1
Tca-Mir-3822 tca-mir-3822 MIR-3822 UAUUUUC MIMAT0018670 MIMAT0018671 LGX 6594368 6594426 + T. castaneum T. castaneum No 1
Tca-Mir-3824 tca-mir-3824 MIR-3824 GUAAAAU MIMAT0018674 MIMAT0018675 LGX 6600300 6600356 + T. castaneum T. castaneum No 1 1
Tca-Mir-3825 tca-mir-3825 MIR-3825 GUUUUCU MIMAT0018678 MIMAT0018679 LGX 6586009 6586065 + T. castaneum T. castaneum No 1
Tca-Mir-3840 tca-mir-3840 MIR-3840 AGUACGA MIMAT0018724 MIMAT0018725 LG3 15689698 15689754 + T. castaneum T. castaneum No
Tca-Mir-3841 tca-mir-3841 MIR-3841 AGUACGG MIMAT0018726 MIMAT0018727 LG3 15689576 15689634 + T. castaneum T. castaneum No 1 1
Tca-Mir-3842 tca-mir-3842 MIR-3842 GGAGGAA MIMAT0018728 MIMAT0018729 LG3 559294 559352 + T. castaneum T. castaneum No
Tca-Mir-3843 tca-mir-3843 MIR-3843 GUUGUUG MIMAT0018732 MIMAT0018733 LG3 15690171 15690228 + T. castaneum T. castaneum No 1
Tca-Mir-3849 tca-mir-3849 MIR-3849 GACAUUU MIMAT0018752 MIMAT0018753 LG5 5505646 5505710 + T. castaneum T. castaneum No 1 1
Tca-Mir-3851-P1 tca-mir-3851h MIR-3851 AGUACGG MIMAT0045530 MIMAT0045531 LG6 9956963 9957020 - T. castaneum T. castaneum No 1
Tca-Mir-3851-P2 tca-mir-3851i MIR-3851 AGUACGG MIMAT0045534 MIMAT0045535 LG6 272921 272978 - T. castaneum T. castaneum No 1 1
Tca-Mir-3851-P3 tca-mir-3851j MIR-3851 AGUACGU MIMAT0045536 MIMAT0045537 LG6 273025 273083 - T. castaneum T. castaneum No
Tca-Mir-3851-P4a tca-mir-3851k-1 MIR-3851 AGUACGA MIMAT0045493 MIMAT0045494 LG2 1145318 1145377 + T. castaneum T. castaneum No 1
Tca-Mir-3851-P4b tca-mir-3851k-2 MIR-3851 AGUACGA MIMAT0045493 MIMAT0045494 LG2 371022 371081 + T. castaneum T. castaneum No 1
Tca-Mir-3851-P4c tca-mir-3851k-3 MIR-3851 AGUACGA MIMAT0045493 MIMAT0045494 KQ972170 26268 26327 + T. castaneum T. castaneum No 1
Tca-Mir-3851-P4d tca-mir-3851k-4 MIR-3851 AGUACGA MIMAT0045493 MIMAT0045494 KQ972170 11063 11122 - T. castaneum T. castaneum No 1
Tca-Mir-3851-P5a tca-mir-3851l-2 MIR-3851 AGUACGA MIMAT0045476 MIMAT0045505 LG2 1141446 1141505 + T. castaneum T. castaneum No 1
Tca-Mir-3851-P5b tca-mir-3851l-2 MIR-3851 AGUACGA MIMAT0045476 MIMAT0045505 KQ971812 8277 8336 - T. castaneum T. castaneum No 1
Tca-Mir-3851-P6 tca-mir-3851l-3 MIR-3851 AGUACGA MIMAT0045554 MIMAT0045477 KQ972048 1592 1650 - T. castaneum T. castaneum No 1 1
Tca-Mir-3851-P7 tca-mir-3851m-4 MIR-3851 GUUGGCA MIMAT0045466 MIMAT0045585 KQ971812 13140 13199 - T. castaneum T. castaneum No
Tca-Mir-3851-P8a tca-mir-3851m-2 MIR-3851 AGUACGA MIMAT0045466 MIMAT0045467 KQ972170 24398 24457 + T. castaneum T. castaneum No
Tca-Mir-3851-P8b tca-mir-3851m-3 MIR-3851 AGUACGA MIMAT0045466 MIMAT0045467 KQ972170 12040 12099 - T. castaneum T. castaneum No
Tca-Mir-3851-P9a tca-mir-3851n-1 MIR-3851 AGUACGA MIMAT0045482 MIMAT0045483 LG2 370015 370074 - T. castaneum T. castaneum No 1
Tca-Mir-3851-P9b tca-mir-3851n-2 MIR-3851 AGUACGA MIMAT0045482 MIMAT0045483 KQ972048 10408 10467 - T. castaneum T. castaneum No 1
Tca-Mir-3853 tca-mir-3853 MIR-3853 UGUGUAU MIMAT0018762 MIMAT0018763 LG5 5943323 5943381 - T. castaneum T. castaneum No
Tca-Mir-3862 tca-mir-3862 MIR-3862 GGGCAAA MIMAT0018800 MIMAT0018801 LG9 14275678 14275733 + T. castaneum T. castaneum No 1
Tca-Mir-3863 tca-mir-3863 MIR-3863 GAUCAAG MIMAT0018808 MIMAT0018809 LG9 14275784 14275842 + T. castaneum T. castaneum No 1
Tca-Mir-3893 tca-mir-3893 MIR-3893 UAAAGCU MIMAT0018888 MIMAT0018889 LG5 7457235 7457292 + T. castaneum T. castaneum No 1
Tca-Mir-6012 tca-mir-6012 MIR-6012 UCGGCGA MIMAT0023565 MIMAT0023566 LG3 7388637 7388698 - Neoptera Neoptera No 1
Tca-Mir-11617-P1 tca-mir-11617b MIR-11617 GUUGUCA MIMAT0045474 MIMAT0045475 LG2 342479 342539 - T. castaneum T. castaneum No
Tca-Mir-11617-P2 tca-mir-11617c MIR-11617 GUUGGCA MIMAT0045478 MIMAT0045479 LG2 364058 364118 - T. castaneum T. castaneum No
Tca-Mir-11617-P3 tca-mir-11617d-1 MIR-11617 AGUACUU MIMAT0045598 None LG2 372276 372333 + T. castaneum T. castaneum No
Tca-Mir-11617-P4 tca-mir-11617d-2 MIR-11617 AGUACUU MIMAT0045598 None KQ972170 27517 27574 + T. castaneum T. castaneum No
Tca-Mir-11617-P5 tca-mir-11617d-3 MIR-11617 AGUACUU MIMAT0045598 None KQ972170 9816 9873 - T. castaneum T. castaneum No
Tca-Mir-11617-P6a tca-mir-11617f-1 MIR-11617 UUGGCAU MIMAT0045600 None LG2 1146293 1146350 + T. castaneum T. castaneum No
Tca-Mir-11617-P6b tca-mir-11617f-2 MIR-11617 UUGGCAU MIMAT0045600 None LG2 1142386 1142443 + T. castaneum T. castaneum No
Tca-Mir-11618-P1 tca-mir-11618a-1 MIR-11618 AUACCGA MIMAT0045489 MIMAT0045490 LG2 1147094 1147152 + T. castaneum T. castaneum No 1
Tca-Mir-11618-P2 tca-mir-11618a-2 MIR-11618 AUACCGA MIMAT0045489 MIMAT0045490 KQ971812 4386 4443 - T. castaneum T. castaneum No 1
Tca-Mir-11618-P3a tca-mir-11618a-3 MIR-11618 UGAUCGG MIMAT0045489 MIMAT0045556 KQ972170 24557 24615 + T. castaneum T. castaneum No 1 1
Tca-Mir-11618-P3b tca-mir-11618a-5 MIR-11618 UGAUCGG MIMAT0045489 MIMAT0045966 KQ972170 11882 11940 - T. castaneum T. castaneum No 1 1
Tca-Mir-11618-P4 tca-mir-11618a-4 MIR-11618 AUACCGA MIMAT0045503 MIMAT0045490 LG2 1143177 1143235 + T. castaneum T. castaneum No 1
Tca-Mir-11618-P5 tca-mir-11618b-1 MIR-11618 GUUAGCA MIMAT0045495 MIMAT0045496 LG2 1144897 1144955 + T. castaneum T. castaneum No 1 1
Tca-Mir-11618-P6 tca-mir-11618b-2 MIR-11618 GUUAGCA MIMAT0045495 MIMAT0045496 LG2 1141029 1141087 + T. castaneum T. castaneum No 1 1
Tca-Mir-11618-P7 tca-mir-11618b-3 MIR-11618 GUUAGCA MIMAT0045495 MIMAT0045555 KQ972170 11485 11543 - T. castaneum T. castaneum No 1 1
Tca-Mir-11618-P8 tca-mir-11618b-4 MIR-11618 AGUACAG MIMAT0045495 MIMAT0045559 KQ972170 25845 25903 + T. castaneum T. castaneum No 1 1
Tca-Mir-11619-P1 tca-mir-11619a-1 MIR-11619 GAAGAGU MIMAT0045515 MIMAT0045558 KQ972170 7940 7998 - T. castaneum T. castaneum No 1
Tca-Mir-11619-P2 tca-mir-11619a-2 MIR-11619 GAAGAGU MIMAT0045515 MIMAT0045558 KQ972170 29392 29450 + T. castaneum T. castaneum No 1
Tca-Mir-11619-P3 tca-mir-11619a-3 MIR-11619 GAAGCGU MIMAT0045515 MIMAT0045516 LG2 374318 374376 + T. castaneum T. castaneum No 1
Tca-Mir-11619-P4 tca-mir-11619e MIR-11619 UGAGGAG MIMAT0045499 MIMAT0045500 LG2 1144051 1144110 + T. castaneum T. castaneum No 1
Tca-Mir-11619-P5 tca-mir-11619f MIR-11619 GAGAGUU MIMAT0045508 MIMAT0045509 LG2 1139937 1139997 + T. castaneum T. castaneum No 1
Tca-Mir-11621-P1 tca-mir-11621 MIR-11621 UAAAGCG MIMAT0045513 MIMAT0045514 LG2 1146138 1146196 + T. castaneum T. castaneum No 1
Tca-Mir-11621-P2a None MIR-11621 UAAAGCG None None LG2 1142245 1142303 + T. castaneum T. castaneum No 1
Tca-Mir-11621-P2b None MIR-11621 UAAAGCG None None KQ972170 27366 27424 + T. castaneum T. castaneum No 1
Tca-Mir-11622 tca-mir-11622 MIR-11622 AAAGGAA MIMAT0045517 MIMAT0045518 LG3 1789933 1789990 - T. castaneum T. castaneum No 1
Tca-Mir-11624-P1a tca-mir-11624a-1 MIR-11624 GAUAUGC MIMAT0045523 MIMAT0045524 LG5 505653 505713 + T. castaneum T. castaneum No
Tca-Mir-11624-P1b tca-mir-11624a-2 MIR-11624 GAUAUGC MIMAT0045523 MIMAT0045524 LG5 48829 48889 - T. castaneum T. castaneum No
Tca-Mir-11624-P2 tca-mir-11624a-3 MIR-11624 GAUAUGC MIMAT0045523 MIMAT0045525 LG5 505254 505313 + T. castaneum T. castaneum No
Tca-Mir-11624-P3 tca-mir-11624b-1 MIR-11624 UUGAGAC MIMAT0045528 MIMAT0045529 LG6 9847531 9847590 - T. castaneum T. castaneum No
Tca-Mir-11624-P4 tca-mir-11624c MIR-11624 GAUAUGC MIMAT0045544 MIMAT0045545 LG6 9853278 9853338 + T. castaneum T. castaneum No
Tca-Mir-11624-P5 tca-mir-11624d MIR-11624 UUGGGAC MIMAT0045532 MIMAT0045533 LG6 9958318 9958377 - T. castaneum T. castaneum No
Tca-Mir-11626 tca-mir-11626a MIR-11626 GGCAUGA MIMAT0045540 MIMAT0045541 LG6 273389 273446 - T. castaneum T. castaneum No
Tca-Mir-11630 tca-mir-11630 MIR-11630 UCAAAUU MIMAT0045552 MIMAT0045553 LGX 3971241 3971303 - T. castaneum T. castaneum No
Tca-Mir-11634 tca-mir-11634 MIR-11634 UUGGGAG MIMAT0045588 MIMAT0045589 LG8 13297445 13297512 + T. castaneum T. castaneum No 1
Tca-Mir-11635 tca-mir-11635 MIR-11635 CUUUGGA None MIMAT0045590 LGX 6586742 6586801 + T. castaneum T. castaneum No 1
Tca-Mir-11636 tca-mir-11636 MIR-11636 GAGGUCU MIMAT0045591 MIMAT0045592 LGX 6593233 6593288 + T. castaneum T. castaneum No 1 1

Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all

Download genome coordinates (GFF format)

Download count matrix