MirGeneDB ID | Mml-Mir-7181 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-7181 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GGAGCCA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Rhesus monkey (Macaca mulatta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | mml-mir-7181 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | M. mulatta | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | M. mulatta | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_003339765.3_Mmul_10_traces) |
CM014355.1: 44102928-44102988 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-7181) |
Mir-138-P2
CM014355.1: 44097876-44097943 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-7181 CM014355.1: 44102928-44102988 [+] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UCAGGGUCCUCUCUGACAGCUGUUCCUUCUUGGGUCCUGGCUGGAGAUCUCUGCUGCCCCCAGACUCAGAGGAGCCACUCCAGGACUCAGGGAGUGGCUGGCUUUGGGCCAGCCCAGCCCUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 UCAGGGUCCUCUCUGAC- - UC C-| AGA GCUGCCC AGCU GU CUUCUUGGGUCCUGG UGG UCUCU \ UCGG CG GAGGGACUCAGGACC ACC GGAGA C UCCCGACCCGACCGGGUU U GU UC^ GA- CUCAGAC . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Mml-Mir-7181_5p* |
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mirBase accession | MIMAT0028308 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UGGGUCCUGGCUGGAGAUCUCU -22
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-7181-5p |
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Mature sequence | Mml-Mir-7181_3p |
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mirBase accession | MIMAT0028309 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
39- AGGAGCCACUCCAGGACUCAGG -61
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-7181-3p |