| MirGeneDB ID | Pab-Mir-430-P22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Family name | MIR-430 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AAAGCGC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Sumatran orangutan (Pongo abelii) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Pab-Mir-430-P1 Pab-Mir-430-P2 Pab-Mir-430-P3 Pab-Mir-430-P4 Pab-Mir-430-P5 Pab-Mir-430-P6 Pab-Mir-430-P7 Pab-Mir-430-P8 Pab-Mir-430-P9a Pab-Mir-430-P9b Pab-Mir-430-P10 Pab-Mir-430-P11 Pab-Mir-430-P12a Pab-Mir-430-P12b Pab-Mir-430-P13 Pab-Mir-430-P14 Pab-Mir-430-P15 Pab-Mir-430-P16 Pab-Mir-430-P17 Pab-Mir-430-P18 Pab-Mir-430-P19 Pab-Mir-430-P20 Pab-Mir-430-P21 Pab-Mir-430-P23 Pab-Mir-430-P24 Pab-Mir-430-P27 Pab-Mir-430-P28 Pab-Mir-430-P29a Pab-Mir-430-P29b Pab-Mir-430-P29c Pab-Mir-430-P30 Pab-Mir-430-P31a Pab-Mir-430-P31b Pab-Mir-430-P32 Pab-Mir-430-P33a Pab-Mir-430-P33b Pab-Mir-430-P34a Pab-Mir-430-P34b Pab-Mir-430-P36 Pab-Mir-430-P37a Pab-Mir-430-P37b Pab-Mir-430-P37c Pab-Mir-430-P38 Pab-Mir-430-P39 Pab-Mir-430-P40a Pab-Mir-430-P40b Pab-Mir-430-P41a Pab-Mir-430-P41b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Hsa-Mir-430-P22 Mml-Mir-430-P22 Sha-Mir-430-o22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Catarrhini | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_028885655.2_NHGRI_mPonAbe1-v2.0_traces) |
CM054699.2: 60083737-60083795 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GCUGGAGCAAGAAGAUCUCAGGCUGUGACCCUCUAGAGGGAAGCACUUUCUCUUGUCUAAAAGAAAAGAAAGCGCUUCUCUUUAGAGGAUUACUCUUUGAGAAGAGCAACGUUGAAGUUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 GCUGGAGCAAGAAGAUC--| CU C A CUUGUCU UCAGG GUGA CCUCUAGAGGGAAGC CUUUCU \ AGUUU CAUU GGAGAUUUCUCUUCG GAAAGA A UUGAAGUUGCAACGAGAAG^ CU A C AAAGAAA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Star sequence | Pab-Mir-430-P22_5p* (predicted) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CUCUAGAGGGAAGCACUUUCUC -22
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mature sequence | Pab-Mir-430-P22_3p (predicted) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- GAAAGCGCUUCUCUUUAGAGGA -59
Get sequence
|
