Mir
Gene
DB
3.0
Home
Browse
Search
Download
Information
34 microRNA genes with node of origin G. gallus
Sort by genome coordinates
Motifs
MirGeneDB ID
▲
MiRBase ID
Family
Seed
5p accession
3p accession
Chromosome
Start
End
Strand
Node of origin (locus)
Node of origin (family)
3' NTU
UG
UGUG
CNNC
Gga-Mir-7-P2c
gga-mir-7-1
MIR-7
GGAAGAC
MIMAT0001157
None
Z
40089600
40089663
-
G. gallus
Bilateria
No
1
Gga-Mir-7-P2d
gga-mir-7b
MIR-7
GGAAGAC
MIMAT0001192
None
W
4705187
4705251
-
G. gallus
Bilateria
No
1
Gga-Mir-122-P1
gga-mir-122-1
MIR-122
GGAGUGU
MIMAT0001190
MIMAT0026550
Z
761062
761119
+
G. gallus
Vertebrata
No
1
1
1
Gga-Mir-122-P2
gga-mir-122-2
MIR-122
GGAGUGU
MIMAT0001190
MIMAT0026550
W
2916998
2917055
-
G. gallus
Vertebrata
No
1
1
Gga-Mir-1452
gga-mir-1452
MIR-1452
UGAGAUA
MIMAT0007328
None
Z
66646493
66646555
+
G. gallus
G. gallus
No
1
Gga-Mir-1550
gga-mir-1550
MIR-1550
GAUGGGG
MIMAT0007403
MIMAT0007404
12
13251466
13251522
+
G. gallus
G. gallus
No
Gga-Mir-1551
gga-mir-1551
MIR-1551
UAGCAGC
MIMAT0007405
MIMAT0007406
14
5612819
5612882
+
G. gallus
G. gallus
No
1
1
Gga-Mir-1553
gga-mir-1553
MIR-1553
GUGGUGG
MIMAT0007409
MIMAT0007410
7
23744593
23744649
+
G. gallus
G. gallus
No
1
Gga-Mir-1555
gga-mir-1555
MIR-1555
AGGGUUA
MIMAT0026774
MIMAT0007412
1
146371379
146371439
-
G. gallus
G. gallus
No
1
Gga-Mir-1560
gga-mir-1560
MIR-1560
GCAUCUC
MIMAT0007417
MIMAT0007418
11
18630380
18630438
-
G. gallus
G. gallus
No
Gga-Mir-1591
gga-mir-1591
MIR-1591
GAUUCAU
MIMAT0007453
MIMAT0007454
7
19311636
19311696
-
G. gallus
G. gallus
No
1
Gga-Mir-1596
gga-mir-1596
MIR-1596
UUCUCCU
MIMAT0007460
MIMAT0007461
1
6347558
6347621
+
G. gallus
G. gallus
No
Gga-Mir-1601
gga-mir-1601
MIR-1601
GCUCUGC
None
MIMAT0007467
24
2042406
2042470
+
G. gallus
G. gallus
No
1
Gga-Mir-1618
gga-mir-1618
MIR-1618
GAGCCCG
MIMAT0026776
MIMAT0007485
8
7822239
7822298
+
G. gallus
G. gallus
No
Gga-Mir-1651
gga-mir-1651
MIR-1651
UGCUUUU
MIMAT0007529
MIMAT0007530
1
1178478
1178535
+
G. gallus
G. gallus
No
Gga-Mir-1663
gga-mir-1663
MIR-1663
ACCGCUG
MIMAT0007544
MIMAT0007545
5
16028827
16028883
+
G. gallus
G. gallus
No
1
Gga-Mir-1668
gga-mir-1668
MIR-1668
GCUGUGU
MIMAT0007551
MIMAT0007552
33
5702513
5702569
-
G. gallus
G. gallus
No
1
Gga-Mir-1669
gga-mir-1669
MIR-1669
UGGGCUC
None
MIMAT0007553
26
3626810
3626871
+
G. gallus
G. gallus
No
Gga-Mir-1677-P3
gga-mir-1744
MIR-1677
CUUCAAC
MIMAT0007648
MIMAT0007649
10
10362855
10362917
+
G. gallus
Diapsida
No
Gga-Mir-1685
gga-mir-1685
MIR-1685
CAGUAAU
MIMAT0007573
MIMAT0007574
2
24783243
24783306
+
G. gallus
G. gallus
No
Gga-Mir-1689
gga-mir-1689
MIR-1689
CGGUGAC
MIMAT0007579
MIMAT0007580
19
9540181
9540243
-
G. gallus
G. gallus
No
1
Gga-Mir-1728
gga-mir-1728
MIR-1728
GGCUUCU
MIMAT0007627
MIMAT0007628
4
10929477
10929544
-
G. gallus
G. gallus
No
1
Gga-Mir-1731
gga-mir-1731
MIR-1731
CUUGACU
MIMAT0007633
MIMAT0026780
12
11048722
11048777
-
G. gallus
G. gallus
No
Gga-Mir-1736
gga-mir-1736
MIR-1736
GCACCUU
MIMAT0007638
MIMAT0007639
1
140535089
140535155
-
G. gallus
G. gallus
No
Gga-Mir-1751
gga-mir-1751
MIR-1751
UGAAGGA
MIMAT0007658
None
4
50089462
50089525
+
G. gallus
G. gallus
No
1
Gga-Mir-1774
gga-mir-1774
MIR-1774
CCCUGCU
None
MIMAT0007685
28
1464741
1464800
+
G. gallus
G. gallus
No
1
Gga-Mir-1806
gga-mir-1806
MIR-1806
GGCAGGA
None
MIMAT0007724
1
95234304
95234363
-
G. gallus
G. gallus
No
1
Gga-Mir-7441
gga-mir-7441
MIR-7441
UGAGGAG
MIMAT0029036
MIMAT0029037
17
2437879
2437941
+
G. gallus
G. gallus
No
Gga-Mir-7462
gga-mir-7462
MIR-7462
AACCUCA
MIMAT0029078
MIMAT0029079
3
54227861
54227921
+
G. gallus
G. gallus
No
Gga-Mir-10585
gga-mir-10585
MIR-10585
GAUGAAA
MIMAT0049964
MIMAT0049965
2
473003
473062
+
G. gallus
G. gallus
No
1
1
Gga-Mir-12223
gga-mir-12223
MIR-12223
AGUUCAG
MIMAT0049923
MIMAT0049924
13
17776577
17776631
-
G. gallus
G. gallus
No
Gga-Mir-12246
gga-mir-12246
MIR-12246
UGGGUGG
MIMAT0049981
MIMAT0049982
21
5009985
5010042
-
G. gallus
G. gallus
No
1
Gga-Mir-12265
gga-mir-12265
MIR-12265
UGGCUGU
MIMAT0050020
MIMAT0050021
3
96496738
96496796
-
G. gallus
G. gallus
No
1
Gga-Mir-12277
gga-mir-12277
MIR-12277
UUGGGUG
MIMAT0050048
MIMAT0050049
5
348189
348254
+
G. gallus
G. gallus
No
1
Download sequences for:
precursor
|
5p
|
3p
|
mature
|
star
|
mature/star
|
loop
|
extend_pre
|
all