MirGeneDB 3.0

34 microRNA genes with node of origin G. gallus
Sort by genome coordinates Motifs
MirGeneDB ID MiRBase ID Family Seed 5p accession 3p accession Chromosome Start End Strand Node of origin (locus) Node of origin (family) 3' NTU  UG  UGUG CNNC
Gga-Mir-7-P2c gga-mir-7-1 MIR-7 GGAAGAC MIMAT0001157 None Z 40089600 40089663 - G. gallus Bilateria No 1
Gga-Mir-7-P2d gga-mir-7b MIR-7 GGAAGAC MIMAT0001192 None W 4705187 4705251 - G. gallus Bilateria No 1
Gga-Mir-122-P1 gga-mir-122-1 MIR-122 GGAGUGU MIMAT0001190 MIMAT0026550 Z 761062 761119 + G. gallus Vertebrata No 1 1 1
Gga-Mir-122-P2 gga-mir-122-2 MIR-122 GGAGUGU MIMAT0001190 MIMAT0026550 W 2916998 2917055 - G. gallus Vertebrata No 1 1
Gga-Mir-1452 gga-mir-1452 MIR-1452 UGAGAUA MIMAT0007328 None Z 66646493 66646555 + G. gallus G. gallus No 1
Gga-Mir-1550 gga-mir-1550 MIR-1550 GAUGGGG MIMAT0007403 MIMAT0007404 12 13251466 13251522 + G. gallus G. gallus No
Gga-Mir-1551 gga-mir-1551 MIR-1551 UAGCAGC MIMAT0007405 MIMAT0007406 14 5612819 5612882 + G. gallus G. gallus No 1 1
Gga-Mir-1553 gga-mir-1553 MIR-1553 GUGGUGG MIMAT0007409 MIMAT0007410 7 23744593 23744649 + G. gallus G. gallus No 1
Gga-Mir-1555 gga-mir-1555 MIR-1555 AGGGUUA MIMAT0026774 MIMAT0007412 1 146371379 146371439 - G. gallus G. gallus No 1
Gga-Mir-1560 gga-mir-1560 MIR-1560 GCAUCUC MIMAT0007417 MIMAT0007418 11 18630380 18630438 - G. gallus G. gallus No
Gga-Mir-1591 gga-mir-1591 MIR-1591 GAUUCAU MIMAT0007453 MIMAT0007454 7 19311636 19311696 - G. gallus G. gallus No 1
Gga-Mir-1596 gga-mir-1596 MIR-1596 UUCUCCU MIMAT0007460 MIMAT0007461 1 6347558 6347621 + G. gallus G. gallus No
Gga-Mir-1601 gga-mir-1601 MIR-1601 GCUCUGC None MIMAT0007467 24 2042406 2042470 + G. gallus G. gallus No 1
Gga-Mir-1618 gga-mir-1618 MIR-1618 GAGCCCG MIMAT0026776 MIMAT0007485 8 7822239 7822298 + G. gallus G. gallus No
Gga-Mir-1651 gga-mir-1651 MIR-1651 UGCUUUU MIMAT0007529 MIMAT0007530 1 1178478 1178535 + G. gallus G. gallus No
Gga-Mir-1663 gga-mir-1663 MIR-1663 ACCGCUG MIMAT0007544 MIMAT0007545 5 16028827 16028883 + G. gallus G. gallus No 1
Gga-Mir-1668 gga-mir-1668 MIR-1668 GCUGUGU MIMAT0007551 MIMAT0007552 33 5702513 5702569 - G. gallus G. gallus No 1
Gga-Mir-1669 gga-mir-1669 MIR-1669 UGGGCUC None MIMAT0007553 26 3626810 3626871 + G. gallus G. gallus No
Gga-Mir-1677-P3 gga-mir-1744 MIR-1677 CUUCAAC MIMAT0007648 MIMAT0007649 10 10362855 10362917 + G. gallus Diapsida No
Gga-Mir-1685 gga-mir-1685 MIR-1685 CAGUAAU MIMAT0007573 MIMAT0007574 2 24783243 24783306 + G. gallus G. gallus No
Gga-Mir-1689 gga-mir-1689 MIR-1689 CGGUGAC MIMAT0007579 MIMAT0007580 19 9540181 9540243 - G. gallus G. gallus No 1
Gga-Mir-1728 gga-mir-1728 MIR-1728 GGCUUCU MIMAT0007627 MIMAT0007628 4 10929477 10929544 - G. gallus G. gallus No 1
Gga-Mir-1731 gga-mir-1731 MIR-1731 CUUGACU MIMAT0007633 MIMAT0026780 12 11048722 11048777 - G. gallus G. gallus No
Gga-Mir-1736 gga-mir-1736 MIR-1736 GCACCUU MIMAT0007638 MIMAT0007639 1 140535089 140535155 - G. gallus G. gallus No
Gga-Mir-1751 gga-mir-1751 MIR-1751 UGAAGGA MIMAT0007658 None 4 50089462 50089525 + G. gallus G. gallus No 1
Gga-Mir-1774 gga-mir-1774 MIR-1774 CCCUGCU None MIMAT0007685 28 1464741 1464800 + G. gallus G. gallus No 1
Gga-Mir-1806 gga-mir-1806 MIR-1806 GGCAGGA None MIMAT0007724 1 95234304 95234363 - G. gallus G. gallus No 1
Gga-Mir-7441 gga-mir-7441 MIR-7441 UGAGGAG MIMAT0029036 MIMAT0029037 17 2437879 2437941 + G. gallus G. gallus No
Gga-Mir-7462 gga-mir-7462 MIR-7462 AACCUCA MIMAT0029078 MIMAT0029079 3 54227861 54227921 + G. gallus G. gallus No
Gga-Mir-10585 gga-mir-10585 MIR-10585 GAUGAAA MIMAT0049964 MIMAT0049965 2 473003 473062 + G. gallus G. gallus No 1 1
Gga-Mir-12223 gga-mir-12223 MIR-12223 AGUUCAG MIMAT0049923 MIMAT0049924 13 17776577 17776631 - G. gallus G. gallus No
Gga-Mir-12246 gga-mir-12246 MIR-12246 UGGGUGG MIMAT0049981 MIMAT0049982 21 5009985 5010042 - G. gallus G. gallus No 1
Gga-Mir-12265 gga-mir-12265 MIR-12265 UGGCUGU MIMAT0050020 MIMAT0050021 3 96496738 96496796 - G. gallus G. gallus No 1
Gga-Mir-12277 gga-mir-12277 MIR-12277 UUGGGUG MIMAT0050048 MIMAT0050049 5 348189 348254 + G. gallus G. gallus No 1

Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all