Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Bo | Br | He | Ki | Li | Ly | Pa | Sk | Sp | Te | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sha-Mir-30-P1a | None | MIR-30 | GUAAACA | None | None | GL841396.1 | 3882213 | 3882274 | - | Gnathostomata | Vertebrata | No | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sha-Mir-30-P1b | None | MIR-30 | GUAAACA | None | None | GL856906.1 | 2327197 | 2327260 | - | Gnathostomata | Vertebrata | No | 1 | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sha-Mir-30-P1d | sha-mir-30e | MIR-30 | GUAAACA | MIMAT0022807 | None | GL849784.1 | 535990 | 536053 | + | Gnathostomata | Vertebrata | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sha-Mir-30-P2a | None | MIR-30 | GUAAACA | None | None | GL841396.1 | 3876298 | 3876357 | - | Gnathostomata | Vertebrata | No | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sha-Mir-30-P2b | None | MIR-30 | GUAAACA | None | None | GL856906.1 | 2283981 | 2284042 | - | Gnathostomata | Vertebrata | No | 1 | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sha-Mir-30-P2d | sha-mir-30c | MIR-30 | GUAAACA | MIMAT0022808 | None | GL849784.1 | 539166 | 539226 | + | Gnathostomata | Vertebrata | No | 1 | 1 |
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all