MirGeneDB ID | Aae-Mir-2941-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-2941 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AGUACGG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Yellow fever mosquito (Aedes aegypti) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | aae-mir-2946 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Aae-Mir-2941-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | A. aegypti | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | A. aegypti | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Aaeg_L3) |
supercont1.385: 413577-413638 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-2941-P1) |
Mir-2941-P2
supercont1.385: 413146-413210 [-]
Ensembl
Mir-2941-P1 supercont1.385: 413577-413638 [-] Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AUGUCUAAGGAGUCAAUAUGAACAAUGAUCGCCAUAUUUUUACCGCUACUGCAUUUCAUUGUAAUAAUUGUAGUACGGAAAAGAUAUGGGGAUUGGGGUUCAUAAUUUCUACUGAGUCUUUGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 AUGUCUAAGGAGUCAAU--| AA G A C UUUCAUU AUGAAC UGAUC CCAUAUUUUU CCG UACUGCA \ UACUUG GUUAG GGUAUAGAAA GGC AUGAUGU G GUUUCUGAGUCAUCUUUAA^ GG G A - UAAUAAU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Aae-Mir-2941-P1_5p* |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- GCCAUAUUUUUACCGCUACUGCA -23
Get sequence
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Mature sequence | Aae-Mir-2941-P1_3p |
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mirBase accession | MIMAT0014325 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
40- UAGUACGGAAAAGAUAUGGGGA -62
Get sequence
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