MirGeneDB ID | Cel-Mir-358-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-358 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UUGGUAU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Roundworm (Caenorhabditis elegans) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | cel-mir-358 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Cel-Mir-358-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Cbr-Mir-358-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Caenorhabditis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Caenorhabditis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (ce11) |
chrV: 8580880-8580948 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-358-v1) |
Mir-357
chrV: 8580565-8580627 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-358-v1 chrV: 8580880-8580948 [-] UCSC Ensembl Mir-358-v2 chrV: 8580880-8580948 [-] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UCUAUCAAUUCAAACUCGCGACGGCUGGCGACCUGGCCAGGCAUUCCAACUGUCAAACUUACAAAGCUUUCUCGACAAUUGGUAUCCCUGUCAAGGUCUCAAUCCGUUCAGCGAAUUCGUUGUUCUAUUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 UCUAUCAAUUCAAACUCGC-- C-| C - C C U C UCAAACUUACA GACGG UGG GACCU GGC AGG AU CCAA UG \ UUGCC ACU CUGGA CUG UCC UA GGUU AC A UUAUCUUGUUGCUUAAGCGAC UA^ - A - C U A AGCUCUUUCGA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Cel-Mir-358-v1_5p* |
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mirBase accession | MIMAT0015120 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- ACCUGGCCAGGCAUUCCAACUG -22
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0015120 |
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Mature sequence | Cel-Mir-358-v1_3p |
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mirBase accession | MIMAT0000700 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
47- AUUGGUAUCCCUGUCAAGGUCU -69
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000700 TargetScanWorm: cel-miR-358 |