MirGeneDB ID | Cel-Mir-791 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-791 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UUGGCAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Roundworm (Caenorhabditis elegans) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | cel-mir-791 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Asu-Mir-791 Cbr-Mir-791 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Chromadorea | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Chromadorea | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (ce11) |
chrX: 5809361-5809423 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-791) |
Mir-230
chrX: 5803908-5803974 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-791 chrX: 5809361-5809423 [+] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AGUCUACUUUGUAGGUUUGAACCUUCGAUUACCUUAUCCGUUGUAGCCAAAGUUCAACGAAGCGGCAACUUUGGCACUCCGCAGAUAAGGCAAUCGAUUGUUUUUGACACUUCAAUACCACGAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 AGUCUACUUUGUAGGUUU-- CU A --| UU A UCAACG GAAC UCGAUU CCUUAUC CG GU GCCAAAGU A UUUG AGCUAA GGAAUAG GC CA CGGUUUCA A AGCACCAUAACUUCACAGUU UU C AC^ CU - ACGGCG 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Cel-Mir-791_5p* |
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mirBase accession | MIMAT0020350 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- ACCUUAUCCGUUGUAGCCAAAGU -23
Get sequence
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Mature sequence | Cel-Mir-791_3p |
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mirBase accession | MIMAT0004226 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
39- UUUGGCACUCCGCAGAUAAGGCAA -63
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0004226 TargetScanWorm: cel-miR-791 |