MirGeneDB ID | Cel-Mir-230 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-230 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | CUUGGUC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Roundworm (Caenorhabditis elegans) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | cel-mir-230 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Cbr-Mir-230 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Caenorhabditis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Caenorhabditis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (ce11) |
chrX: 5803908-5803974 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-230) |
Mir-230
chrX: 5803908-5803974 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-791 chrX: 5809361-5809423 [+] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UUUUUUGUCUGAUGUUGAUGUAAUGCCGUCACUUGGUCGGCGAUUUAAUAUUAUCAGAACAUAGGAAAUUGUUAGUAUUAGUUGUGCGACCAGGAGACGGUAUUCGCAUAUUUCUUAAAUAUUCAUUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 UUUUUUGUCUGAUGUUG- - A -| U UCAGAACAU AUGU AAUGCCGUC CUUGGUCG GCGAUU AAUAUUA \ UACG UUAUGGCAG GGACCAGC UGUUGA UUAUGAU A UUACUUAUAAAUUCUUUA C A G^ - UGUUAAAGG 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Cel-Mir-230_5p |
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mirBase accession | MIMAT0015113 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- ACUUGGUCGGCGAUUUAAUAUUA -23
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0015113 |
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Co-mature sequence | Cel-Mir-230_3p |
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mirBase accession | MIMAT0000285 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
44- GUAUUAGUUGUGCGACCAGGAGA -67
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000285 TargetScanWorm: cel-miR-230 |