MirGeneDB ID | Dme-Mir-284 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-284 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | CUGGAAU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Fruit fly (Drosophila melanogaster) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dme-mir-284 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Dan-Mir-284 Dmo-Mir-284 Dsi-Mir-284 Dya-Mir-284 Gpa-Mir-284 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Glossinidae + Drosophilidae | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Glossinidae + Drosophilidae | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Drosophila_melanogaster_BDGP6) |
3R: 12551526-12551605 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CUUCGGAUAAUCGGUGAUUGCGUUGCAGUUCCUGGAAUUAAGUUGACUGUGUAGCCUGUGAGGGCAAGGCUUGAAUAAUGCUCCUGAAGUCAGCAACUUGAUUCCAGCAAUUGCGGCCCGAUAUUCCUCAACAAUGAGAAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 CUUCGGAUAAUCGGUGA--| C C A UGUAGCCUGUGAGGGCAAGG UUG GUUGCAGUU CUGGAAUUAAGUUG CUG \ AGC CGGCGUUAA GACCUUAGUUCAAC GAC C AAGAGUAACAACUCCUUAU^ C C - UGAAGUCCUCGUAAUAAGUU . 130 120 110 100 90 80 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Dme-Mir-284_5p |
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mirBase accession | MIMAT0020811 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CCUGGAAUUAAGUUGACUGUGUAGC -25
Get sequence
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Co-mature sequence | Dme-Mir-284_3p |
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mirBase accession | MIMAT0000348 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
58- GUCAGCAACUUGAUUCCAGCAA -80
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000348 TargetScanFly: dme-miR-284 |