MirGeneDB ID | Dno-Mir-361-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-361 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UAUCAGA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Nine-banded armadillo (Dasypus novemcinctus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dno-mir-361 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Dno-Mir-361-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-361-v1 Cfa-Mir-361-v1 Cja-Mir-361-v1 Cpo-Mir-361-v1 Eca-Mir-361-v1 Ete-Mir-361-v1 Hsa-Mir-361-v1 Laf-Mir-361 Mml-Mir-361-v1 Mmr-Mir-361-v1 Mmu-Mir-361-v1 Ocu-Mir-361-v1 Pab-Mir-361-v1 Rno-Mir-361-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (dasNov3) |
JH574981: 206921-206984 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-361-v1) |
Mir-361-v1
JH574981: 206921-206984 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-361-v2 JH574981: 206922-206983 [-] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GGCAGUGAUUGUUUCCUGGGAUUUGGGAGCUUAUCAGAAUCUCCAGGGGUACUUAAUAUGUGAAAAAAGUCCCCCAGGUGUGAUUCUGAUUUGCUUCCUUCUCCCCCUCCUCCUUUGAGAAUCAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 GGCAGUGAUUGUUUCCU-- UUU UU U--| A U UUAAUAU GGGA GGGAGC AUCAGAAUC CC GGGG AC G CCCU CCUUCG UAGUCUUAG GG CCCC UG U ACUAAGAGUUUCCUCCUCC CUU UU UGU^ A C AAAAAAG 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Dno-Mir-361-v1_5p |
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mirBase accession | MIMAT0047829 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UUAUCAGAAUCUCCAGGGGUAC -22
Get sequence
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Star sequence | Dno-Mir-361-v1_3p* |
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mirBase accession | MIMAT0047830 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
40- CCCCCAGGUGUGAUUCUGAUUUGC -64
Get sequence
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