MirGeneDB ID | Cfa-Mir-361-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-361 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UAUCAGA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Dog (Canis familiaris) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | cfa-mir-361 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Cfa-Mir-361-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-361-v1 Cpo-Mir-361-v1 Dno-Mir-361-v1 Ete-Mir-361-v1 Hsa-Mir-361-v1 Mml-Mir-361-v1 Mmu-Mir-361-v1 Ocu-Mir-361-v1 Rno-Mir-361-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (canFam3_add) |
chrX: 66698698-66698760 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-361-v1) |
Mir-361-v1
chrX: 66698698-66698760 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-361-v2 chrX: 66698699-66698759 [-] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GACAGUGAUUCUUCCCUGGGACUUGGGAGUUUAUCAGAAUCUCCAGGGGUACUUAAAAUUUGAAAAAGUCCCCCAGGUGUGAUUCUGAUUUGCUCCCUCUUCCUCUUUCUCUGAGAAUCACUGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 GACAGUGAUUCUUCCCU-- CUU UU U--| A U UUAAAAU GGGA GGGAGU AUCAGAAUC CC GGGG AC \ UCCU CCCUCG UAGUCUUAG GG CCCC UG U GUCACUAAGAGUCUCUUUC UCU UU UGU^ A C AAAAAGU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Cfa-Mir-361-v1_5p |
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mirBase accession | MIMAT0006751 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UUAUCAGAAUCUCCAGGGGUAC -22
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: cfa-miR-361 miRDB: MIMAT0006751 |
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Star sequence | Cfa-Mir-361-v1_3p* |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
39- CCCCCAGGUGUGAUUCUGAUUUGC -63
Get sequence
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