| MirGeneDB ID | Dsi-Mir-969 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-969 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AGUUCCA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila simulans) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dsi-mir-969 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Dan-Mir-969 Dme-Mir-969 Dmo-Mir-969 Dya-Mir-969 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Drosophila | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Drosophila | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Drosophila_simulans.ASM75419v3.dna.toplevel) |
X: 17106556-17106617 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-969) |
Mir-969
X: 17106556-17106617 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-210-v1 X: 17110595-17110653 [+] UCSC Ensembl Mir-210-v2 X: 17110595-17110653 [+] UCSC Ensembl |
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| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GGGGAAUCCCCAAGUCUCUGUCCUACGUCCGAGUUCCACUAAGCAAGUUUUGAGAUCGUUUUAAAAACAAAAACUUGACACGUUGAGCUCGUUCGUGGGAUGGACUACUGCAAUUCAAAAUCGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 GGGGAAUCCCCAAGUCU--| UC C UAAG GAGAUCGU CUGUCCUACG CGAGUUC AC CAAGUUUU U GGUAGGGUGC GCUCGAG UG GUUCAAAA U CUAAAACUUAACGUCAUCA^ UU U CACA ACAAAAAU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Dsi-Mir-969_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0012479 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GAGUUCCACUAAGCAAGUUUU -21
Get sequence
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| Co-mature sequence | Dsi-Mir-969_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0012480 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
41- AACUUGACACGUUGAGCUCGU -62
Get sequence
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