MirGeneDB ID | Efe-Mir-137-P9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-137 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AUUGCUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Common brandling worm (Eisenia fetida) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Efe-Mir-137-P4 Efe-Mir-137-P5 Efe-Mir-137-P6 Efe-Mir-137-P7 Efe-Mir-137-P8 Efe-Mir-137-P10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aga-Mir-137 Agr-Mir-137 Asu-Mir-137 Ava-Mir-137 Bfl-Mir-137 Bko-Mir-137 Bpl-Mir-137 Cbr-Mir-137 Cel-Mir-137 Cte-Mir-137 Dan-Mir-137 Dgr-Mir-137 Dma-Mir-137 Dme-Mir-137 Dmo-Mir-137 Dpu-Mir-137 Dsi-Mir-137 Dya-Mir-137 Eba-Mir-137 Ebu-Mir-137 Esc-Mir-137 Gpa-Mir-137 Hme-Mir-137 Hru-Mir-137 Isc-Mir-137 Lan-Mir-137 Lgi-Mir-137 Lhy-Mir-137 Llo-Mir-137 Mgi-Mir-137 Mom-Mir-137 Obi-Mir-137 Ofu-Mir-137 Pau-Mir-137 Pca-Mir-137 Pdu-Mir-137 Pve-Mir-137 Rph-Mir-137 Sko-Mir-137 Snu-Mir-137 Spu-Mir-137 Tur-Mir-137 War-Mir-137 Xbo-Mir-137 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | E. fetida | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Efe_combined) |
Efet.01.626403: 916-977 [+] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UCGAGACAGAGAACCAGCGCGCAGCUGAUCACGUGUAUUCUUAGGUAAAUAAUAUGGUGUGUUUUAUUGUUAUUGCUUGAGAAUACACGUAGUCAACUCGGCUCCUUCUGCUAAUGCUUCAUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 UCGAGACAGAGAACCAGCG---| C C C A AUGGUGU CG AG UGAU ACGUGUAUUCUUAGGUAA UAAU \ GC UC ACUG UGCACAUAAGAGUUCGUU AUUG G UACUUCGUAAUCGUCUUCCUCG^ - A A - UUAUUUU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Efe-Mir-137-P9_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- ACGUGUAUUCUUAGGUAAAUAAU -23
Get sequence
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Mature sequence | Efe-Mir-137-P9_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
40- UAUUGCUUGAGAAUACACGUAG -62
Get sequence
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