MirGeneDB 3.0
MirGeneDB ID

Bpl-Mir-137

Family name MIR-137 (all species)
Seed UAUUGCU
Species Monogonont Rotifer 1 (Brachionus plicatilis)
MiRBase ID
Paralogues
Orthologues Aae-Mir-137-P11  Aae-Mir-137-P12  Aca-Mir-137-P1-v1  Aca-Mir-137-P1-v2  Aca-Mir-137-P3-v1  Aca-Mir-137-P3-v2  Aga-Mir-137  Agr-Mir-137  Ami-Mir-137-P1-v1  Ami-Mir-137-P1-v2  Ami-Mir-137-P3-v1  Ami-Mir-137-P3-v2  Asu-Mir-137  Ava-Mir-137  Bfl-Mir-137  Bge-Mir-137-P13-v1  Bge-Mir-137-P13-v2  Bge-Mir-137-P14-v1  Bge-Mir-137-P14-v2  Bko-Mir-137  Bla-Mir-137-P15a  Bla-Mir-137-P15b  Bla-Mir-137-P15c  Bta-Mir-137-P1-v1  Bta-Mir-137-P1-v2  Cbr-Mir-137  Cel-Mir-137  Cfa-Mir-137-P1-v1  Cfa-Mir-137-P1-v2  Cja-Mir-137-P1-v1  Cja-Mir-137-P1-v2  Cli-Mir-137-P1-v1  Cli-Mir-137-P1-v2  Cli-Mir-137-P3  Cmi-Mir-137-P1  Cpi-Mir-137-P1-v1  Cpi-Mir-137-P1-v2  Cpi-Mir-137-P3-v1  Cpi-Mir-137-P3-v2  Csc-Mir-137-P21  Csc-Mir-137-P22  Cte-Mir-137  Dan-Mir-137  Dgr-Mir-137  Dma-Mir-137  Dme-Mir-137  Dmo-Mir-137  Dno-Mir-137-P1-v1  Dno-Mir-137-P1-v2  Dpu-Mir-137  Dre-Mir-137-P1a-v1  Dre-Mir-137-P1a-v2  Dre-Mir-137-P1b-v1  Dre-Mir-137-P1b-v2  Dsi-Mir-137  Dya-Mir-137  Eba-Mir-137  Ebu-Mir-137  Eca-Mir-137-P1  Efe-Mir-137-P4  Efe-Mir-137-P5  Efe-Mir-137-P6  Efe-Mir-137-P7  Efe-Mir-137-P8  Efe-Mir-137-P9  Efe-Mir-137-P10  Esc-Mir-137  Ete-Mir-137-P1-v1  Ete-Mir-137-P1-v2  Gga-Mir-137-P1-v1  Gga-Mir-137-P1-v2  Gga-Mir-137-P3-v1  Gga-Mir-137-P3-v2  Gja-Mir-137-P1-v1  Gja-Mir-137-P1-v2  Gja-Mir-137-P3  Gmo-Mir-137-P1b-v1  Gmo-Mir-137-P1b-v2  Gmo-Mir-137-P3a-v1  Gmo-Mir-137-P3a-v2  Gmo-Mir-137-P3b-v1  Gmo-Mir-137-P3b-v2  Gpa-Mir-137  Hme-Mir-137  Hru-Mir-137  Hsa-Mir-137-P1-v1  Hsa-Mir-137-P1-v2  Isc-Mir-137  Laf-Mir-137-P1  Lan-Mir-137  Lch-Mir-137-P1  Lch-Mir-137-P3  Lgi-Mir-137  Lhy-Mir-137  Llo-Mir-137  Loc-Mir-137-P1-v1  Loc-Mir-137-P1-v2  Loc-Mir-137-P3-v1  Loc-Mir-137-P3-v2  Lpo-Mir-137-P16  Lpo-Mir-137-P17  Lpo-Mir-137-P18  Lpo-Mir-137-P19  Lpo-Mir-137-P20  Mal-Mir-137-P1b-v1  Mal-Mir-137-P1b-v2  Mal-Mir-137-P3a-v1  Mal-Mir-137-P3a-v2  Mal-Mir-137-P3b-v1  Mal-Mir-137-P3b-v2  Mdo-Mir-137-P1-v1  Mdo-Mir-137-P1-v2  Mdo-Mir-137-P3-v1  Mdo-Mir-137-P3-v2  Mgi-Mir-137  Mml-Mir-137-P1-v1  Mml-Mir-137-P1-v2  Mmr-Mir-137-P1  Mmu-Mir-137-P1-v1  Mmu-Mir-137-P1-v2  Mom-Mir-137  Mun-Mir-137-P1  Mun-Mir-137-P3  Neu-Mir-137-P1  Neu-Mir-137-P3  Oan-Mir-137-P1-v1  Oan-Mir-137-P1-v2  Oan-Mir-137-P3-v1  Oan-Mir-137-P3-v2  Obi-Mir-137  Ocu-Mir-137-P1-v1  Ocu-Mir-137-P1-v2  Ofu-Mir-137  Ovu-Mir-137-v1  Ovu-Mir-137-v2  Pab-Mir-137-P1-v1  Pab-Mir-137-P1-v2  Pau-Mir-137  Pbv-Mir-137-P1-v1  Pbv-Mir-137-P1-v2  Pbv-Mir-137-P3-v1  Pbv-Mir-137-P3-v2  Pca-Mir-137  Pdu-Mir-137  Pfl-Mir-137-v1  Pfl-Mir-137-v2  Pma-Mir-137-o1  Pma-Mir-137-o2  Pma-Mir-137-o3  Pmi-Mir-137-v1  Pmi-Mir-137-v2  Pve-Mir-137  Rno-Mir-137-P1-v1  Rno-Mir-137-P1-v2  Rph-Mir-137  Sha-Mir-137-P1-v1  Sha-Mir-137-P1-v2  Sha-Mir-137-P3  Sko-Mir-137  Snu-Mir-137  Spt-Mir-137-P1  Spu-Mir-137  Sto-Mir-137-P1  Tca-Mir-137-v1  Tca-Mir-137-v2  Tgu-Mir-137-P1-v1  Tgu-Mir-137-P1-v2  Tni-Mir-137-P3b  Tur-Mir-137  War-Mir-137  Xbo-Mir-137  Xla-Mir-137-P1  Xtr-Mir-137-P1 
Node of Origin (locus) Bilateria
Node of Origin (family) Bilateria
Genome context
(Bpl_ASM1027981)		 QEOQ01000204.1: 46455-46526 [-] Ensembl
Precursor
(pre-Mir +30nt flank)
GUGAUCAAUUAAAAGUGCUCUAAAUAAAUCCGUGUAUUCAACAGCAAUUGAUAAUAGCUAAAAAUCGGCAAUGCCAAUUAUUAUUGCUGUAGAAUAUACAUAUUUUCUAAAGCGAUGCAACUGUUAAACAAA
Get precursor sequence
Structure
        10        20        30          40        50        60      
GUGAUCAAUUAAAAGUGCUCUAAAUAAAUCC--|       A        U    AUAGCUAAAAAU 
                                 GUGUAUUC ACAGCAAU GAUA            \
                                 CAUAUAAG UGUCGUUA UUAU            C
AAACAAAUUGUCAACGUAGCGAAAUCUUUUAUA^       A        -    UAACCGUAACGG 
130       120       110       100        90         80        70
Deep sequencing
Go to detailed chart
3' NTU Unknown
MotifsCNNC at 3p(+17)
Tissue expression
-   +
To
Star sequence

Bpl-Mir-137_5p*
mirBase accessionNone
Sequence 
0- CGUGUAUUCAACAGCAAUUGAUA -23
Get sequence
Mature sequence

Bpl-Mir-137_3p (predicted)
mirBase accessionNone
Sequence 
50- UUAUUGCUGUAGAAUAUACAUA -72
Get sequence