MirGeneDB ID | Mdo-Mir-137-P3-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-137 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AUUGCUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Gray short-tailed opossum (Monodelphis domestica) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | mdo-mir-137b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Mdo-Mir-137-P1-v1 Mdo-Mir-137-P1-v2 Mdo-Mir-137-P3-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aca-Mir-137-P3-v1 Aca-Mir-137-P3-v2 Ami-Mir-137-P3-v1 Ami-Mir-137-P3-v2 Asu-Mir-137 Bfl-Mir-137 Cbr-Mir-137 Cel-Mir-137 Cgi-Mir-137 Cli-Mir-137-P3 Cpi-Mir-137-P3-v1 Cpi-Mir-137-P3-v2 Cte-Mir-137 Dan-Mir-137 Dma-Mir-137 Dme-Mir-137 Dmo-Mir-137 Dpu-Mir-137 Dsi-Mir-137 Dya-Mir-137 Ebu-Mir-137 Esc-Mir-137 Gga-Mir-137-P3-v1 Gga-Mir-137-P3-v2 Gja-Mir-137-P3 Gmo-Mir-137-P3a-v1 Gmo-Mir-137-P3a-v2 Gmo-Mir-137-P3b-v1 Gmo-Mir-137-P3b-v2 Hme-Mir-137 Isc-Mir-137 Lan-Mir-137 Lch-Mir-137-P3 Lgi-Mir-137 Loc-Mir-137-P3-v1 Loc-Mir-137-P3-v2 Mal-Mir-137-P3a-v1 Mal-Mir-137-P3a-v2 Mal-Mir-137-P3b-v1 Mal-Mir-137-P3b-v2 Mun-Mir-137-P3 Oan-Mir-137-P3-v1 Oan-Mir-137-P3-v2 Obi-Mir-137 Pbv-Mir-137-P3-v1 Pbv-Mir-137-P3-v2 Pma-Mir-137-o3 Sha-Mir-137-P3 Sko-Mir-137 Spu-Mir-137 Tni-Mir-137-P3b Xbo-Mir-137 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (monDom5_add) |
3: 429645669-429645729 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-137-P3-v2) |
Mir-137-P3-v2
3: 429645669-429645729 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-137-P3-v1 3: 429645670-429645728 [-] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | ACCCUACCCCAUUGCCUAGCCCCCCGCGAUGACGGGUAUUCUUGGGUAGAUAAUACCAAUGGCGCUGUUAUUGCUUGAGAAUACACGUAGUCGAGGGGAGGCCUCUUCGACGAUCCCCACCGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 ACCCUACCCCAUUGCCUA- -| G G G UG A ACCAA GCC CCCC CGAU ACG GUAUUCU GGUAG UAAU U CGG GGGG GCUG UGC CAUAAGA UCGUU AUUG G CCACCCCUAGCAGCUUCUC A^ A A A GU - UCGCG . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Mdo-Mir-137-P3-v2_5p* (predicted) |
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mirBase accession | MIMAT0028552 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- GACGGGUAUUCUUGGGUAGAUAAU -24
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: mdo-miR-137b-5p |
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Mature sequence | Mdo-Mir-137-P3-v2_3p |
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mirBase accession | MIMAT0028553 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
38- UAUUGCUUGAGAAUACACGUAGU -61
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: mdo-miR-137b-3p |