MirGeneDB 3.0
MirGeneDB ID

Oan-Mir-137-P1-v1

Family name MIR-137 (all species)
Seed UAUUGCU
Species Platypus (Ornithorhynchus anatinus)
MiRBase ID oan-mir-137a
Paralogues Oan-Mir-137-P1-v2  Oan-Mir-137-P3-v1  Oan-Mir-137-P3-v2 
Orthologues Aca-Mir-137-P1-v1  Aca-Mir-137-P1-v2  Aga-Mir-137  Agr-Mir-137  Ami-Mir-137-P1-v1  Ami-Mir-137-P1-v2  Asu-Mir-137  Ava-Mir-137  Bfl-Mir-137  Bko-Mir-137  Bpl-Mir-137  Bta-Mir-137-P1-v1  Bta-Mir-137-P1-v2  Cbr-Mir-137  Cel-Mir-137  Cfa-Mir-137-P1-v1  Cfa-Mir-137-P1-v2  Cja-Mir-137-P1-v1  Cja-Mir-137-P1-v2  Cli-Mir-137-P1-v1  Cli-Mir-137-P1-v2  Cmi-Mir-137-P1  Cpi-Mir-137-P1-v1  Cpi-Mir-137-P1-v2  Cte-Mir-137  Dan-Mir-137  Dgr-Mir-137  Dma-Mir-137  Dme-Mir-137  Dmo-Mir-137  Dno-Mir-137-P1-v1  Dno-Mir-137-P1-v2  Dpu-Mir-137  Dre-Mir-137-P1a-v1  Dre-Mir-137-P1a-v2  Dre-Mir-137-P1b-v1  Dre-Mir-137-P1b-v2  Dsi-Mir-137  Dya-Mir-137  Eba-Mir-137  Ebu-Mir-137  Eca-Mir-137-P1  Esc-Mir-137  Ete-Mir-137-P1-v1  Ete-Mir-137-P1-v2  Gga-Mir-137-P1-v1  Gga-Mir-137-P1-v2  Gja-Mir-137-P1-v1  Gja-Mir-137-P1-v2  Gmo-Mir-137-P1b-v1  Gmo-Mir-137-P1b-v2  Gpa-Mir-137  Hme-Mir-137  Hru-Mir-137  Hsa-Mir-137-P1-v1  Hsa-Mir-137-P1-v2  Isc-Mir-137  Laf-Mir-137-P1  Lan-Mir-137  Lch-Mir-137-P1  Lgi-Mir-137  Lhy-Mir-137  Llo-Mir-137  Loc-Mir-137-P1-v1  Loc-Mir-137-P1-v2  Mal-Mir-137-P1b-v1  Mal-Mir-137-P1b-v2  Mdo-Mir-137-P1-v1  Mdo-Mir-137-P1-v2  Mgi-Mir-137  Mml-Mir-137-P1-v1  Mml-Mir-137-P1-v2  Mmr-Mir-137-P1  Mmu-Mir-137-P1-v1  Mmu-Mir-137-P1-v2  Mom-Mir-137  Mun-Mir-137-P1  Neu-Mir-137-P1  Obi-Mir-137  Ocu-Mir-137-P1-v1  Ocu-Mir-137-P1-v2  Ofu-Mir-137  Pab-Mir-137-P1-v1  Pab-Mir-137-P1-v2  Pau-Mir-137  Pbv-Mir-137-P1-v1  Pbv-Mir-137-P1-v2  Pca-Mir-137  Pdu-Mir-137  Pma-Mir-137-o1  Pve-Mir-137  Rno-Mir-137-P1-v1  Rno-Mir-137-P1-v2  Rph-Mir-137  Sha-Mir-137-P1-v1  Sha-Mir-137-P1-v2  Sko-Mir-137  Snu-Mir-137  Spt-Mir-137-P1  Spu-Mir-137  Sto-Mir-137-P1  Tgu-Mir-137-P1-v1  Tgu-Mir-137-P1-v2  Tur-Mir-137  War-Mir-137  Xbo-Mir-137  Xla-Mir-137-P1  Xtr-Mir-137-P1 
Node of Origin (locus) Gnathostomata
Node of Origin (family) Bilateria
Genome context
(mOrnAna1.p.v1_plustraces)		 NC_041731.1: 90584395-90584453 [+]
Clustered miRNAs
(< 50kb from Mir-137-P1-v1)		 Mir-137-P1-v2 NC_041731.1: 90584394-90584454 [+]
Mir-137-P1-v1 NC_041731.1: 90584395-90584453 [+]
Precursor
(pre-Mir +30nt flank)
GCAGCUUCGUCUUUCUGACUCUCUUCGGUGACGGGUAUUCUUGGGUGGAUAAUACGGAUUACGUUGUUAUUGCUUAAGAAUACGCGUAGUCGAGGAGAGUAUCUGCGGCAGGCAGCGGC
Get precursor sequence
Structure
        10          20        30        40        50         
GCAGCUUCGUCUUUCUG--|          UG   G           UG AUAAUACGGA 
                   ACUCUCUUCGG  ACG GUAUUCUUGGG  G          \
                   UGAGAGGAGCU  UGC CAUAAGAAUUC  U          U
CGGCGACGGACGGCGUCUA^          GA   G           GU AUUGUUGCAU 
       110       100        90        80        70        60
Deep sequencing
Go to detailed chart
3' NTU No
MotifsCNNC at 3p(+17)
Tissue expression
-   +
Br Ce He Ki Te
Star sequence

Oan-Mir-137-P1-v1_5p*
mirBase accessionMIMAT0006837
Sequence 
0- ACGGGUAUUCUUGGGUGGAUA -21
Get sequence
Mature sequence

Oan-Mir-137-P1-v1_3p
mirBase accessionMIMAT0006838
Sequence 
36- UUAUUGCUUAAGAAUACGCGUAG -59
Get sequence