MirGeneDB ID | Hsa-Mir-605-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-605 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AAGGCAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Human (Homo sapiens) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | hsa-mir-605 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Hsa-Mir-605-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Cja-Mir-605 Mml-Mir-605-v2 Pab-Mir-605 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Simiiformes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Simiiformes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (hg38) |
chr10: 51299587-51299645 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-605-v2) |
Mir-605-v2
chr10: 51299587-51299645 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-605-v1 chr10: 51299588-51299644 [+] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GUAACAUAUGUCUCUAGCCCUAGCUUGGUUCUAAAUCCCAUGGUGCCUUCUCCUUGGGAAAAACAGAGAAGGCACUAUGAGAUUUAGAAUCAAGUUAGGACUGCAGAUACAGGUUACCUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 GUAACAUAUGUCUCUAGC--| C CUUGGG CCUAGCUUGGUUCUAAAUC CAUGGUGCCUUCUC \ GGAUUGAACUAAGAUUUAG GUAUCACGGAAGAG A UCCAUUGGACAUAGACGUCA^ A ACAAAA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Hsa-Mir-605-v2_5p* |
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mirBase accession | MIMAT0003273 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CUAAAUCCCAUGGUGCCUUCUC -22
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0003273 TargetScanVert: hsa-miR-605-5p miRDB: MIMAT0003273 |
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Mature sequence | Hsa-Mir-605-v2_3p |
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mirBase accession | MIMAT0026621 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
37- GAAGGCACUAUGAGAUUUAGAA -59
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: hsa-miR-605-3p miRDB: MIMAT0026621 |