MirGeneDB ID | Laf-Mir-374-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-374 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UAUAAUA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | African bush elephant (Loxodonta africana) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-374-P2 Cfa-Mir-374-P2 Cja-Mir-374-P2 Eca-Mir-374-P2 Hsa-Mir-374-P2 Mml-Mir-374-P2 Mmu-Mir-374-P2 Ocu-Mir-374-P2 Pab-Mir-374-P2 Rno-Mir-374-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_000001905.1_Loxafr3.0) |
GL010051.1: 27592597-27592648 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UGCUUCUCCGAAGAAAUCCUGCUCGGAUGAAUAUAAUACAACCUGCUAAGUGUCCUAGCACUUAUCAGGCUGUAUUAUCAUUGUCCGUGUCUAUGGCUCUCGUCUACCAGACGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 UGCUUCUCCGAAGAAAUCCU--| U UG AU A C UC GC CGGA A AUAAUACA CCUG UAAGUG C UG GCCU U UAUUAUGU GGAC AUUCAC U CAGACCAUCUGCUCUCGGUAUC^ U GU AC C U GA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Laf-Mir-374-P2_5p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AUAUAAUACAACCUGCUAAGUG -22
Get sequence
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Star sequence | Laf-Mir-374-P2_3p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
30- CUUAUCAGGCUGUAUUAUCAUU -52
Get sequence
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