MirGeneDB ID | Mml-Mir-605-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-605 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GAAGGCA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Rhesus monkey (Macaca mulatta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | mml-mir-605 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Mml-Mir-605-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Cja-Mir-605 Hsa-Mir-605-v1 Pab-Mir-605 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Simiiformes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Simiiformes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_003339765.3_Mmul_10_traces) |
CM014344.1: 86668781-86668837 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-605-v1) |
Mir-605-v2
CM014344.1: 86668780-86668838 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-605-v1 CM014344.1: 86668781-86668837 [-] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UAACAUAUGUCUGUAACCCUAGCUUGGUUCUAAAUCCCACGGUGCCUUCUCCUUGGGAAAAACAGAGAAGGCACUGUGGGAUUUAGAACCAAGUUAGGACUAAAGAUUCAGAUUACCGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 UAACAUAUGUCUGUAAC--| CUUGGG CCUAGCUUGGUUCUAAAUCCCACGGUGCCUUCUC \ GGAUUGAACCAAGAUUUAGGGUGUCACGGAAGAG A CCAUUAGACUUAGAAAUCA^ ACAAAA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Mml-Mir-605-v1_5p* |
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mirBase accession | MIMAT0006460 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UAAAUCCCACGGUGCCUUCUCC -22
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-605 |
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Mature sequence | Mml-Mir-605-v1_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
35- AGAAGGCACUGUGGGAUUUAGA -57
Get sequence
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