MirGeneDB ID | Mmu-Mir-3059 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-3059 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UUCCUCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | mmu-mir-3059 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-3059 Cfa-Mir-3059 Cja-Mir-3059 Cpo-Mir-3059 Dno-Mir-3059 Eca-Mir-3059 Ete-Mir-3059 Hsa-Mir-3059 Laf-Mir-3059 Mml-Mir-3059 Mmr-Mir-3059 Ocu-Mir-3059 Pab-Mir-3059 Rno-Mir-3059 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (mm10) |
chr10: 101772704-101772761 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UUACACAGGUGUAUCACAGGUGGUACGCCCUUUCCUCUCUGCCCCAUAGGGUGUAGCUCUAACUACCCUCUAGGGAAGAGAAGGUUGGGUGAACAGCCUUACUAUUUCUACAACUCAGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 UUACACAGGUGUAUCAC--| G A UUU - G CAU UAGC AGGU GU CGCCC CCU CUCU CCC AGGGUG U UCCG CA GUGGG GGA GAGA GGG UCCCAU C GACUCAACAUCUUUAUCAU^ A A UU- A A AUC CAAU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Mmu-Mir-3059_5p |
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mirBase accession | MIMAT0014811 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UUUCCUCUCUGCCCCAUAGGGUGU -24
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-3059-5p miRDB: MIMAT0014811 |
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Star sequence | Mmu-Mir-3059_3p* |
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mirBase accession | MIMAT0014812 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
36- CCUCUAGGGAAGAGAAGGUUGG -58
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-3059-3p miRDB: MIMAT0014812 |