| MirGeneDB ID | Ocu-Mir-3059 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-3059 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UUCCUCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Rabbit (Oryctolagus cuniculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | ocu-mir-3059 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-3059 Cfa-Mir-3059 Cpo-Mir-3059 Dno-Mir-3059 Ete-Mir-3059 Hsa-Mir-3059 Mml-Mir-3059 Mmu-Mir-3059 Rno-Mir-3059 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (oryCun2_add) |
chr4: 65833049-65833106 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UUACACAGGUGUAACACAGGUGGUACGCCCUUUCCUCUCUGCCCCAUAGGGUGUAGCUCUAACUGCCCUCUAGGGAAGAGAAGGUUGGGUGAACAGCCUUACUAUUUCUCCAGCUCAGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 UUACACAGGUGUAACAC--| G A UUU - G CAU GUAGC AGGU GU CGCCC CCU CUCU CCC AGGGU U UCCG CA GUGGG GGA GAGA GGG UCCCG C GACUCGACCUCUUUAUCAU^ A A UU- A A AUC UCAAU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Ocu-Mir-3059_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0048607 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UUUCCUCUCUGCCCCAUAGGGUG -23
Get sequence
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| Star sequence | Ocu-Mir-3059_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | MIMAT0048608 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- CUCUAGGGAAGAGAAGGUUGG -58
Get sequence
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